RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 ADAMTS20P59510 1910 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-214ENST00000490425 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 LILRA5A6NI73 299 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 ZNF185O15231 689 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 POLBP06746 335 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 CCL4P13236 92 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 ADRA1DP25100 572 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 PSMA3P25788 255 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 SLC5A2P31639 672 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 FOXN2P32314 431 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 PRLHRP49683 370 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 EPHA4P54764 986 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 GPS1Q13098 491 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 GPR18Q14330 331 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 METRNLQ641Q3 311 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 C4orf22Q6V702 233 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 CLEC14AQ86T13 490 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 SPACA3Q8IXA5 215 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 CFAP206Q8IYR0 622 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 AVL9Q8NBF6 648 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 ZNF248Q8NDW4 579 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 HEXDCQ8WVB3 486 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 USP7Q93009 1102 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 RANBP9Q96S59 729 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 UCK1Q9HA47 277 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 SLC40A1Q9NP59 571 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 SNX12Q9UMY4 172 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 PRSS21Q9Y6M0 314 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 ATMQ13315 3056 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 PRAMEF10O60809 474 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 UBXN7O94888 489 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 GOT2P00505 430 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 KRT14P02533 472 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 COILP38432 576 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 ABCG1P45844 678 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 GFERP55789 205 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 ZNF534Q76KX8 674 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 AGBL5Q8NDL9 886 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 OR6P1Q8NGX9 317 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 KCNE4Q8WWG9 221 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 RSC1A1Q92681 617 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 PMEPA1Q969W9 287 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 TMEM159Q96B96 161 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 RMDN2Q96LZ7 410 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 CHRAC1Q9NRG0 131 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 POT1Q9NUX5 634 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 WDR70Q9NW82 654 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 FOXJ2Q9P0K8 574 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 PDP2Q9P2J9 529 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 ACSL5Q9ULC5 683 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 KALRNO60229 2985 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 C9orf172C9J069 976 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 HGSO14964 777 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 KLK10O43240 276 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 OR1I1O60431 355 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 SLC35G4P0C7Q5 338 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 AMD1P17707 334 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 TPSB2P20231 275 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 MGAT1P26572 445 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 PREPP48147 710 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 TLE3Q04726 772 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 LAMB3Q13751 1172 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 SEMA3AQ14563 771 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 KCNJ11Q14654 390 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 TPSAB1Q15661 275 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 CYP1B1Q16678 543 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 PCID2Q5JVF3 399 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 ANKRD22Q5VYY1 191 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 AFTPHQ6ULP2 937 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 FAM129CQ86XR2 697 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 HM13Q8TCT9 377 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 C12orf66Q96MD2 445 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 TGM7Q96PF1 710 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 CCM2Q9BSQ5 444 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 EPB41L1Q9H4G0 881 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 COG4Q9H9E3 785 aa11.75□□□□□ -0.53
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