RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 OMA1Q96E52 524 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 AKIP1Q9NQ31 210 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 C14orf119Q9NWQ9 140 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEB16A2A368 324 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PAGE1O75459 146 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PCSK1P29120 753 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 IFNA8P32881 189 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CYP4F2P78329 520 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CYP4F3Q08477 520 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PAGE3Q5JUK9 113 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 WDR45BQ5MNZ6 344 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 OVOS1Q6IE37 1185 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 LCN8Q6JVE9 175 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CLYBLQ8N0X4 340 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ELMOD1Q8N336 334 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 OR13J1Q8NGT2 312 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ARPC5LQ9BPX5 153 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 KATNAL1Q9BW62 490 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DSN1Q9H410 356 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GMIPQ9P107 970 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TRPV2Q9Y5S1 764 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ITIH1P19827 911 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GGT5P36269 586 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEA12P43365 314 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 KCNC4Q03721 635 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 NPTX1Q15818 432 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MORN1Q5T089 497 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MFSD6LQ8IWD5 586 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2J2Q8N2K1 259 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 OR7G1Q8NGA0 311 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GPX3P22352 226 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SCNN1AP37088 669 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 RPL34P49207 117 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 STEAP3Q658P3 488 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MINDY2Q8NBR6 621 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TEKT5Q96M29 485 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SLC39A8Q9C0K1 460 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 FAM118AQ9NWS6 357 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SCN3BQ9NY72 215 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 COQ3Q9NZJ6 369 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF487B1APH4 448 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 HAS3O00219 553 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 FAM20BO75063 409 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TBX18O95935 607 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 BMPR1AP36894 532 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GP2P55259 537 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 UFM1P61960 85 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SLC39A12Q504Y0 691 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 XKR4Q5GH76 650 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PEX5LQ8IYB4 626 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 STON2Q8WXE9 905 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PSD2Q9BQI7 771 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 RTP3Q9BQQ7 232 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 AZIN1O14977 448 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CNTN5O94779 1100 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DNTTP04053 509 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 RBP1P09455 135 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ODC1P11926 461 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CD36P16671 472 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PAMP19021 973 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GRK4P32298 578 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GALNT12Q8IXK2 581 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TRPV1Q8NER1 839 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC126Q96EE4 140 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ACOX2Q99424 681 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DCSTAMPQ9H295 470 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CDH9Q9ULB4 789 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 EFCAB9A8MZ26 197 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TSPAN3O60637 253 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms