RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa16.4■□□□□ 0.22
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GALPQ9UBC7 116 aa16.4■□□□□ 0.22
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF366Q8N895 744 aa16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMYD1Q8NB12 490 aa16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TLE6Q9H808 572 aa16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TLR6Q9Y2C9 796 aa16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CACNA1SQ13698 1873 aa16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1W2PRU2 124 aa16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TXNDC8Q6A555 127 aa16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MOCOSQ96EN8 888 aa16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAPNS2Q96L46 248 aa16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPY6RQ99463 290 aa16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CORO2BQ9UQ03 480 aa16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DMTF1Q9Y222 760 aa16.38■□□□□ 0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAPPAQ13219 1627 aa16.38■□□□□ 0.21
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