RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476594.1

CCM2-208, Transcript of CCM2 scaffold protein, human

TSL 3

Gene CCM2, Length 533 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCM2-208	ENST00000476594	PRORY	Q9H606	182 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	PDP2	Q9P2J9	529 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	PRR19	A6NJB7	356 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	EFCAB7	A8K855	629 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594		A8MU76	341 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	MATN2	O00339	956 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	PFDN6	O15212	129 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	GPR39	O43194	453 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	PRAMEF10	O60809	474 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	RASSF9	O75901	435 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	SUN1	O94901	812 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	AP2A2	O94973	939 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	FTH1	P02794	183 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	APRT	P07741	180 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	TPH1	P17752	444 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ADRA1D	P25100	572 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ARL4D	P49703	201 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	PRAME	P78395	509 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	XIAP	P98170	497 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	CDK16	Q00536	496 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	PRKAA1	Q13131	559 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	RPA4	Q13156	261 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	NFE2L1	Q14494	772 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	METRNL	Q641Q3	311 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	OOSP2	Q86WS3	158 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ART4	Q93070	314 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	PBK	Q96KB5	322 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	C12orf66	Q96MD2	445 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	RANBP9	Q96S59	729 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	CD180	Q99467	661 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	RAB33B	Q9H082	229 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	KLHL3	Q9UH77	587 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	KCTD3	Q9Y597	815 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ITPR1	Q14643	2758 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	TK2	O00142	265 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	AGRP	O00253	132 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	MAP3K7	O43318	606 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	KIF5C	O60282	957 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	C9	P02748	559 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	OR56A5	P0C7T3	313 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	CCL4	P13236	92 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	BRAF	P15056	766 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	TYRP1	P17643	537 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	MPST	P25325	297 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ETV5	P41161	510 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	CLN3	Q13286	438 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	GPR18	Q14330	331 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	PTPRCAP	Q14761	206 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	RPE65	Q16518	533 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	IRGC	Q6NXR0	463 aa		10	□□□□□ -0.81
CCM2-208	ENST00000476594	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		10	□□□□□ -0.81

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