RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 NCOA7Q8NI08 942 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 GPT2Q8TD30 523 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF503Q96F45 646 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 EEF2KMTQ96G04 330 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL5Q96PQ7 755 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 HAUS8Q9BT25 410 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SRD5A3Q9H8P0 318 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL1Q9NR64 748 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SPG21Q9NZD8 308 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 HMG20BQ9P0W2 317 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF150Q9ULK6 438 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PPQ1 181 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 HEPACAM2A8MVW5 462 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 J3QR06 171 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MGST3O14880 152 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 XRCC3O43542 346 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SMPD2O60906 423 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CRCPO75575 148 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM16O95361 564 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ACSL3O95573 720 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 LBPP18428 481 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RARRES1P49788 294 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CFHR1Q03591 330 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2V1Q13404 147 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TNK1Q13470 666 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 STIM1Q13586 685 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SYT16Q17RD7 645 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 IFI44LQ53G44 452 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 EPHA10Q5JZY3 1008 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 DCAF12L2Q5VW00 463 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 LCN10Q6JVE6 187 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 NOTUMQ6P988 496 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 BEST3Q8N1M1 668 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 EMC1Q8N766 993 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 URGCPQ8TCY9 931 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RIT1Q92963 219 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MOB3AQ96BX8 217 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ORAI1Q96D31 301 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA33Q96N06 139 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SFXN2Q96NB2 322 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TIMP4Q99727 224 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SEMA3CQ99985 751 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR26Q9H7D7 661 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 P4HTMQ9NXG6 502 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 GMEB2Q9UKD1 530 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RABL2BQ9UNT1 228 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 AURKCQ9UQB9 309 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TO15178 435 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 FCGR3BO75015 233 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 NME6O75414 186 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 FGBP02675 491 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 ABHD2P08910 425 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 C8orf89P0DMQ9 161 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 CD22P20273 847 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNA5P22460 613 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 PLA2G5P39877 138 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 DGCR2P98153 550 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 GAD2Q05329 585 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXM1Q08050 763 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 LAMB3Q13751 1172 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKDD1AQ495B1 522 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 TCTE1Q5JU00 501 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 C6orf10Q5SRN2 563 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 C12orf60Q5U649 245 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 FRG2Q64ET8 278 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 BRAT1Q6PJG6 821 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 OLFM4Q6UX06 510 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 ISLR2Q6UXK2 745 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms