RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 SERPINB3P29508 390 aa16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 HK3P52790 923 aa16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 GBX1Q14549 363 aa16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 TGFBIQ15582 683 aa16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 WASHC2DQ5SRD0 308 aa16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 IER5LQ5T953 404 aa16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 SBSNQ6UWP8 590 aa16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 MAVSQ7Z434 540 aa16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 CACUL1Q86Y37 369 aa16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 PELI3Q8N2H9 469 aa16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 SKA1Q96BD8 255 aa16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 MYLK2Q9H1R3 596 aa16.11■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 A0A1W2PP55 124 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 INPP4BO15327 924 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 HOXB2P14652 356 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 GPR1P46091 355 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 NAA20P61599 178 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 ZBTB16Q05516 673 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 RAET1GQ6H3X3 334 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 TMPRSS6Q8IU80 811 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 AGAP11Q8TF27 550 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 FAM131CQ96AQ9 280 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 ERP27Q96DN0 273 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 MSANTD3Q96H12 275 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 EBF4Q9BQW3 602 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 EPHX3Q9H6B9 360 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 COG4Q9H9E3 785 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 CD274Q9NZQ7 290 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 VTI1BQ9UEU0 232 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 SERGEFQ9UGK8 458 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 UNC80Q8N2C7 3258 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 MYO10Q9HD67 2058 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 K7ESM1 405 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 HDAC3O15379 428 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 NARSO43776 548 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 TM7SF2O76062 418 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 PCDH8O95206 1070 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 FTH1P02794 183 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 KRT16P08779 473 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 IDH3AP50213 366 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 FBXO43Q4G163 708 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 EPGNQ6UW88 154 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 AGR3Q8TD06 166 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 ASB2Q96Q27 587 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 FBXL12Q9NXK8 326 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 NUDT4Q9NZJ9 180 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 ZFP69BQ9UJL9 534 aa16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 IGLON5A6NGN9 336 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 SHISA7A6NL88 538 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 OR2AG2A6NM03 316 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 NUAK1O60285 661 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 SNX2O60749 519 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 DNTTP04053 509 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 C7P10643 843 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 COL9A1P20849 921 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 AGERQ15109 404 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 PPP1R3AQ16821 1122 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 LEXMQ3ZCV2 418 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 SEL1L3Q68CR1 1132 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 ANKS6Q68DC2 871 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 FRA10AC1Q70Z53 315 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 CLNKQ7Z7G1 428 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 CUZD1Q86UP6 607 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 RILPQ96NA2 401 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 OARD1Q9Y530 152 aa16.09■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 RAD51BO15315 384 aa16.08■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 GRID2O43424 1007 aa16.08■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 PRLHRP49683 370 aa16.08■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 CTSCP53634 463 aa16.08■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.08■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 TUBB3Q13509 450 aa16.08■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 SLC44A4Q53GD3 710 aa16.08■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 SH2D4BQ5SQS7 431 aa16.08■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa16.08■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 FAM91A1Q658Y4 838 aa16.08■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 KIRREL3Q8IZU9 778 aa16.08■□□□□ 0.17
USP20-204ENST00000472108 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms