RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 GPRC6AQ5T6X5 926 aa22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 THAP4Q8WY91 577 aa22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 MRGPRX2Q96LB1 330 aa22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 CD180Q99467 661 aa22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 HRASLS2Q9NWW9 162 aa22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 TLCD2A6NGC4 264 aa22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 BUD23O43709 281 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 AKR1B10O60218 316 aa22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 CDKN2BP42772 138 aa22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 UQCRFS1P47985 274 aa22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 ARL4DP49703 201 aa22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 TAZQ16635 292 aa22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 ODF2Q5BJF6 829 aa22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 CPZQ66K79 652 aa22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 LURAP1LQ8IV03 231 aa22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 HACD3Q9P035 362 aa22.09■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 CENPEQ02224 2701 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 TTLL8A6PVC2 850 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 F5H423 210 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 TNNT1P13805 278 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 RPS15P62841 145 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 TUBB4BP68371 445 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 IL10RAQ13651 578 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 TUBB2AQ13885 445 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 SLC1A5Q15758 541 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 SYVN1Q86TM6 617 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 FCRL5Q96RD9 977 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 CHP1Q99653 195 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 MED13Q9UHV7 2174 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 CST8O60676 142 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 SLC1A1P43005 524 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 PDE1BQ01064 536 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 ADCY2Q08462 1091 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 CHAF1BQ13112 559 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 GPS2Q13227 327 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 XRCC4Q13426 336 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 ITGA9Q13797 1035 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 TFDP2Q14188 446 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 PTPRCAPQ14761 206 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 LLGL1Q15334 1064 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 GPR19Q15760 415 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 SLC38A9Q8NBW4 561 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 GALNT11Q8NCW6 608 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 ZFPM2Q8WW38 1151 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 WWP1Q9H0M0 922 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 KCND1Q9NSA2 647 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 SMOXQ9NWM0 555 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 PKP3Q9Y446 797 aa22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 OR6C74A6NCV1 312 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 MGAT4DA6NG13 374 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 VPS4BO75351 444 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 SCRG1O75711 98 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 GNLYP22749 145 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 CCL11P51671 97 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 PGDP52209 483 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 C4orf17Q53FE4 359 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 DET1Q7L5Y6 550 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 PID1Q7Z2X4 250 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 TMEM126BQ8IUX1 230 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 ZNF567Q8N184 647 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 IPMKQ8NFU5 416 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 OR8K5Q8NH50 307 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 CPT1CQ8TCG5 803 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 ZNF398Q8TD17 642 aa22.06■■□□□ 1.12
USP4-208ENST00000464168 NAT14Q8WUY8 206 aa22.06■■□□□ 1.12
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