RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 IPPKQ9H8X2 491 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 FFAR2O15552 330 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 PRAMEF1O95521 474 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ALDH1A1P00352 501 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 LDLRP01130 860 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 UMPSP11172 480 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 MTPNP58546 118 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 AAK1Q2M2I8 961 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 AP5B1Q2VPB7 878 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CYP20A1Q6UW02 462 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 BOCQ9BWV1 1114 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 A0A087WXM4 84 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 K7ERQ8 282 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 LSM1O15116 133 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CLOCKO15516 846 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 HOXA2O43364 376 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 BMP10O95393 424 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 NPPAP01160 153 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 HMOX2P30519 316 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 HSPA7P48741 367 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 DGKQP52824 942 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ABRAXAS2Q15018 415 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 GLYATQ6IB77 296 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 PROSER1Q86XN7 944 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 OFCC1Q8IZS5 231 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CHID1Q9BWS9 393 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 APOL5Q9BWW9 433 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SRRDQ9UH36 339 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 VPS51Q9UID3 782 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 GBF1Q92538 1859 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 RAD51BO15315 384 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 FZD6O60353 706 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 OTCP00480 354 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CDK9P50750 372 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 MILR1Q7Z6M3 343 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 MYO19Q96H55 970 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ACTL8Q9H568 366 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 BMP1P13497 986 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 BFSP2Q13515 415 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SELPLGQ14242 412 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 DPP10Q8N608 796 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 RAET1EQ8TD07 263 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 C8orf4Q9NR00 106 aa20.16■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 DYTNA2CJ06 578 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 TRIM16O95361 564 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CSKP41240 450 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ESRRGP62508 458 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 BIRC2Q13490 618 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CDH18Q13634 790 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 LHX8Q68G74 356 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 LRRC43Q8N309 656 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 EGFL8Q99944 293 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ASB8Q9H765 288 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ATXN10Q9UBB4 475 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ST14Q9Y5Y6 855 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 C7P10643 843 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CA5AP35218 305 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 PYCR3Q53H96 274 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 GPR141Q7Z602 305 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa20.15■□□□□ 0.82
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