RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 ZFP1Q6P2D0 407 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 B4GALT6Q9UBX8 382 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 ST14Q9Y5Y6 855 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 WASF2Q9Y6W5 498 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 TRIM38O00635 465 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 CEBPBP17676 345 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 SESN3P58005 492 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 PSME3P61289 254 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 TUBGCP3Q96CW5 907 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 NPAS2Q99743 824 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 VCX3BQ9H321 246 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC167Q9P0B6 97 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 NDUFAF1Q9Y375 327 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 TRIM16O95361 564 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 OR56A5P0C7T3 313 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 ARHGEF7Q14155 803 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 DHDDSQ86SQ9 333 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 CHST14Q8NCH0 376 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC26A7Q8TE54 656 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 ZSWIM3Q96MP5 696 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 KLHL32Q96NJ5 620 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNA7Q96RP8 456 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF225Q9UK10 706 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 PPM1HQ9ULR3 514 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 WNT6Q9Y6F9 365 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 DOCK6Q96HP0 2047 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 PLXNA2O75051 1894 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 FBP2O00757 339 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP6AP2O75787 350 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 OTCP00480 354 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 VCLP18206 1134 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 THOP1P52888 689 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 NTHL1P78549 312 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 TCEAL5Q5H9L2 206 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 PRMT9Q6P2P2 845 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 MRASO14807 208 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 HGFP14210 728 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 MSH3P20585 1137 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 CDKL1Q00532 357 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 CEACAM7Q14002 265 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 GBX1Q14549 363 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 DHCR24Q15392 516 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 KIF19Q2TAC6 998 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 SPATS1Q496A3 300 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM215Q68D42 235 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM126BQ8IUX1 230 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 FUNDC1Q8IVP5 155 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 CLDN19Q8N6F1 224 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 OSCP1Q8WVF1 389 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 BRINP2Q9C0B6 783 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 BRWD1Q9NSI6 2320 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 UPK3BL1B0FP48 263 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 UPK3BL2E5RIL1 263 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 KPNA5O15131 536 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 BNIP3LO60238 219 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 AP2A2O94973 939 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 ADH1CP00326 375 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 BMP1P13497 986 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 PIK3CGP48736 1102 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 GTF2H2Q13888 395 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 SPAG4Q9NPE6 437 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 AIG1Q9NVV5 245 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 GPR45Q9Y5Y3 372 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 C5orf42Q9H799 3197 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 MYOFQ9NZM1 2061 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1B0GTL3 188 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 CISD3P0C7P0 127 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC00032P0C843 101 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 MPC1LP0DKB6 136 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 DPP6P42658 865 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP2-202ENST00000435136 FOXM1Q08050 763 aa18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms