RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 STARD8Q92502 1023 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 ULK4Q96C45 1275 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 ARL5AQ9Y689 179 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 CFAP99D6REC4 459 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 NKX2-8O15522 239 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 GPR39O43194 453 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 MT-ND3P03897 115 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 PRKAR1AP10644 381 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 FGF5P12034 268 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 TCN2P20062 427 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 PSMB4P28070 264 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 ADRA1AP35348 466 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 HADHAP40939 763 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 ZNF75DP51815 510 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 SH3BP2P78314 561 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 CDC20Q12834 499 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 KCNAB2Q13303 367 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 NFE2L1Q14494 772 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 PPP1R3BQ86XI6 285 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 TTC13Q8NBP0 860 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 SPATA13Q96N96 652 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 C19orf43Q9BQ61 176 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 CLMPQ9H6B4 373 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-206ENST00000431413 WISP1O95388 367 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 ITGALP20701 1170 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 VAV2P52735 878 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 ACY1Q03154 408 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 SEPT6Q14141 434 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 KRT33BQ14525 404 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 GSE1Q14687 1217 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 C16orf46Q6P387 395 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 DET1Q7L5Y6 550 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 KIAA1328Q86T90 577 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 KMT5CQ86Y97 462 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 OR2L2Q8NH16 312 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 ELMO2Q96JJ3 720 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 CD180Q99467 661 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 TBL1YQ9BQ87 522 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 APOL2Q9BQE5 337 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 IL17BQ9UHF5 180 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 KCND3Q9UK17 655 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 AMFRQ9UKV5 643 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 RARRES3Q9UL19 164 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 RCCD1A6NED2 376 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 SUV39H1O43463 412 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 KIAA0754O94854 1291 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 NDUFS1P28331 727 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 DLSTP36957 453 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 CSRP3P50461 194 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 TUBB3Q13509 450 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 PTPRCAPQ14761 206 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 BCL7AQ4VC05 210 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 PEX26Q7Z412 305 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 OOSP2Q86WS3 158 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 GPR150Q8NGU9 434 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 C12orf66Q96MD2 445 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 COPS8Q99627 209 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 WWP1Q9H0M0 922 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms