RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa18.43■□□□□ 0.54
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHST14Q8NCH0 376 aa18.4■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IRF7Q92985 503 aa18.4■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PBXIP1Q96AQ6 731 aa18.4■□□□□ 0.54
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 HBEGFQ99075 208 aa18.4■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COPS8Q99627 209 aa18.4■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM54Q9BYV2 358 aa18.4■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRD9Q9H8M2 597 aa18.4■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HEBP1Q9NRV9 189 aa18.4■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TDP1Q9NUW8 608 aa18.4■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WWOXQ9NZC7 414 aa18.4■□□□□ 0.54
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC154A6NI56 674 aa18.39■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP3K13O43283 966 aa18.39■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1SP09871 688 aa18.39■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP6V1B2P21281 511 aa18.39■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFYCQ13952 458 aa18.39■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC73Q5JTD7 316 aa18.39■□□□□ 0.53
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