RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-210	ENST00000415055	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055		B4E171	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	SNX2	O60749	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	RTN2	O75298	545 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	KIF20A	O95235	890 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	RARG	P13631	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ITGB6	P18564	788 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	TSPAN7	P41732	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	PSMD8	P48556	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	NXPH1	P58417	271 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	CYP4F2	P78329	520 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	GTF2B	Q00403	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	PRKG2	Q13237	762 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ENPP2	Q13822	863 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	TAF5	Q15542	800 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	TMEM215	Q68D42	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055		A0A1W2PR77	199 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055		A1L4Q6	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ACTL6B	O94805	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	AGFG2	O95081	481 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	GCNT3	O95395	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	RALA	P11233	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	CKMT1A	P12532	417 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	CCDC130	P13994	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	TNNI1	P19237	187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	CAPN3	P20807	821 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	TGM2	P21980	687 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	DGKA	P23743	735 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	ADORA2B	P29275	332 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC6A4	P31645	630 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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