RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 PRKACBP22694 351 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 LHCGRP22888 699 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 CA5AP35218 305 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 CLCN7P51798 805 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 GPR33Q49SQ1 333 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 UNC50Q53HI1 259 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM78AQ5JUQ0 283 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 GPR26Q8NDV2 337 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM13CQ8NE31 585 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 TNIP2Q8NFZ5 429 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 FBXO27Q8NI29 283 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 NAT14Q8WUY8 206 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 STON2Q8WXE9 905 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 MEI4A8MW99 385 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 LEFTY1O75610 366 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 COPAP53621 1224 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 CDH13P55290 713 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 PTSQ03393 145 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGEF7Q14155 803 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 CMPK2Q5EBM0 449 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 BRAT1Q6PJG6 821 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 C12orf40Q86WS4 652 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGAP24Q8N264 748 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 NXPE1Q8N323 547 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 CLDN19Q8N6F1 224 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 FRS2Q8WU20 508 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 CMTM5Q96DZ9 223 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 ZFYVE19Q96K21 471 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 APOL5Q9BWW9 433 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 SCOCQ9UIL1 159 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 FBXO10Q9UK96 956 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 DHRS7Q9Y394 339 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 C5orf42Q9H799 3197 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 TULP3O75386 442 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 NFATC1O95644 943 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 CISD3P0C7P0 127 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 ITGB6P18564 788 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 FSHRP23945 695 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 ETV3P41162 512 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 PTPN5P54829 565 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 BTKQ06187 659 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 COX10Q12887 443 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 KLF10Q13118 480 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 DNAL1Q4LDG9 190 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 SGCDQ92629 289 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 FGF13Q92913 245 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 SMARCD2Q92925 531 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 ASB16Q96NS5 453 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 GBP5Q96PP8 586 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 ASB2Q96Q27 587 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 SPATA16Q9BXB7 569 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 PBX4Q9BYU1 374 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 EBF3Q9H4W6 596 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 KANSL1LA0AUZ9 987 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 SDHDO14521 159 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGAP33O14559 1287 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 SNX2O60749 519 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 TRIM16O95361 564 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 C1SP09871 688 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 ARSAP15289 507 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms