RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408953.3

ZBED8-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED8, Length 2,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8-201ENST00000408953 ADGRE2Q9UHX3 823 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 GSTA4O15217 222 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 HTR6P50406 440 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 SELENBP1Q13228 472 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 PHKG1Q16816 387 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 ALFQ53S48 1182 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 PIK3R6Q5UE93 754 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 LRRTM3Q86VH5 581 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 OR4L1Q8NH43 312 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 ARRDC2Q8TBH0 407 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 HASPINQ8TF76 798 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 VMP1Q96GC9 406 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 IKZF5Q9H5V7 419 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 SIAEQ9HAT2 523 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 SP110Q9HB58 689 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 CATSPERZQ9NTU4 200 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 ERVK-18Q9QC07 812 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 DNAJB9Q9UBS3 223 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED8-201ENST00000408953 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 GMNNO75496 209 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 PRKD3O94806 890 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 HPRP00739 348 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 FMO3P31513 532 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 GJA8P48165 433 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 GABARAPL2P60520 117 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 NCS1P62166 190 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 CATSPEREQ5SY80 951 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 CCDC81Q6ZN84 652 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 BEND5Q7L4P6 421 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 ADCK1Q86TW2 530 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 TMEM86AQ8N2M4 240 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 DPP10Q8N608 796 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 OR2T12Q8NG77 320 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 SLC47A1Q96FL8 570 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 GPR21Q99679 349 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 RHNO1Q9BSD3 238 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 ACTR8Q9H981 624 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 SYCE1LA8MT33 242 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 MITFO75030 526 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 GABARAPO95166 117 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 FTH1P02794 183 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 PFKLP17858 780 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 GGT5P36269 586 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 HK3P52790 923 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 STC1P52823 247 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 IL5RAQ01344 420 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 SLC13A2Q13183 592 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 LAPTM4AQ15012 233 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 C6orf183Q5T699 404 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 TXNDC11Q6PKC3 985 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 GALNT5Q7Z7M9 940 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 PJA1Q8NG27 643 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 MCOLN3Q8TDD5 553 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 S100ZQ8WXG8 99 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 SEMA3CQ99985 751 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 NMUR1Q9HB89 426 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 PARNO95453 639 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 CHRNA1P02708 482 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 ERVPABLB-1P60509 514 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 CDC42EP1Q00587 391 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 CDK5R2Q13319 367 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 RAPSNQ13702 412 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 DUSP28Q4G0W2 176 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 DEPDC1Q5TB30 811 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 NECAB2Q7Z6G3 386 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 SCD5Q86SK9 330 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 UGT2B28Q9BY64 529 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 DERL2Q9GZP9 239 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 CXCL11O14625 94 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 PFDN6O15212 129 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 RPP40O75818 363 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 ALOX5P09917 674 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 CYP4B1P13584 511 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 PCSK1P29120 753 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 CD6P30203 668 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 RAD51Q06609 339 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF691Q5VV52 312 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 LETMD1Q6P1Q0 360 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED8-201ENST00000408953 CYP20A1Q6UW02 462 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms