RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 DSG4Q86SJ6 1040 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 C12orf40Q86WS4 652 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 SNX32Q86XE0 403 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 NRSN1Q8IZ57 195 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 KYQ8NBH2 561 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 TMIEQ8NEW7 156 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 FAM83CQ9BQN1 747 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 EFCAB1Q9HAE3 211 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 RDH14Q9HBH5 336 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 CDH7Q9ULB5 785 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 COL4A3Q01955 1670 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 E2F3O00716 465 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 PEX11AO75192 247 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 FTH1P02794 183 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 C8GP07360 202 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 CTSLP07711 333 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 TIMP2P16035 220 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 MSH3P20585 1137 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 ITGB7P26010 798 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 PIK3CGP48736 1102 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 ACADVLP49748 655 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 NUDT2P50583 147 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 SLC25A3Q00325 362 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 SEMG2Q02383 582 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 FCHO2Q0JRZ9 810 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 SP140Q13342 867 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 PPP1R3AQ16821 1122 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 UGT3A2Q3SY77 523 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 LRRC73Q5JTD7 316 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 LDLRAP1Q5SW96 308 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 C1orf146Q5VVC0 180 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM198Q66K66 360 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 SULT1C3Q6IMI6 304 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 DDIASQ8IXT1 998 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 TCAIMQ8N3R3 496 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 TERB1Q8NA31 727 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 DDHD1Q8NEL9 900 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 FBXO27Q8NI29 283 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 UBTD2Q8WUN7 234 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 VPS35Q96QK1 796 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 EGFL8Q99944 293 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 TRIM54Q9BYV2 358 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 DYRK4Q9NR20 520 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 RIC8BQ9NVN3 520 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-202ENST00000395322 DOCK8Q8NF50 2099 aa10.96□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 PIP5K1BO14986 540 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 OTCP00480 354 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 MPC1LP0DKB6 136 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 BMP1P13497 986 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 LBPP18428 481 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 ITGAXP20702 1163 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 MAPK9P45984 424 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 HK3P52790 923 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 RALGDSQ12967 914 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 ART3Q13508 389 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 ACSBG2Q5FVE4 666 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 ANKRD54Q6NXT1 300 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 NEK10Q6ZWH5 1172 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 DEFB107AQ8IZN7 70 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 PGAM4Q8N0Y7 254 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 JADE3Q92613 823 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 ZFYVE19Q96K21 471 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 SLC25A23Q9BV35 468 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 APOL5Q9BWW9 433 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 IGFLR1Q9H665 355 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 WWOXQ9NZC7 414 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 SLC7A8Q9UHI5 535 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 BCAP29Q9UHQ4 241 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 CD84Q9UIB8 345 aa10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms