RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 A8MU76 341 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP104O60308 925 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 TYRP1P17643 537 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 AMD1P17707 334 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ACRV1P26436 265 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 GRIA1P42261 906 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 LMAN1P49257 510 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ARSDP51689 593 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 TGIF1Q15583 401 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 DTX1Q86Y01 620 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 BMPERQ8N8U9 685 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ART4Q93070 314 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 DDA1Q9BW61 102 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CASS4Q9NQ75 786 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 EFCAB7A8K855 629 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 GAS8O95995 478 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 APRTP07741 180 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD34CP0C6C1 535 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PRSS56P0CW18 603 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CXCR5P32302 372 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 GFERP55789 205 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 RAB15P59190 212 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CACNG1Q06432 222 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 VAC14Q08AM6 782 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC38Q502W7 563 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 MICALCLQ6ZW33 695 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM129CQ86XR2 697 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PIANPQ8IYJ0 282 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR150Q8NGU9 434 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PMEPA1Q969W9 287 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 C9orf72Q96LT7 481 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 RANBP9Q96S59 729 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 RAB33BQ9H082 229 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC39A1Q9NY26 324 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 KLHL3Q9UH77 587 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 HEATR9A2RTY3 570 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 K7ENP7 123 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CAPZBP47756 277 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 MC2RQ01718 297 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 LAMB3Q13751 1172 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP40Q5TG30 622 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 C4orf22Q6V702 233 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 TAS2R42Q7RTR8 314 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CFAP206Q8IYR0 622 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 HM13Q8TCT9 377 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 RSC1A1Q92681 617 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 WWP1Q9H0M0 922 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXO8Q9NRD0 319 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 EPHA6Q9UF33 1036 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC78A2IDD5 438 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 EFSO43281 561 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ADRA1DP25100 572 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNJ1P48048 391 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 DBN1Q16643 649 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 DCAF12Q5T6F0 453 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC81Q6ZN84 652 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFPM2Q8WW38 1151 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 KALRNO60229 2985 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC162PA2VCL2 907 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 STMND1H3BQB6 276 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXN2P32314 431 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ACVR1Q04771 509 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ITIH4Q14624 930 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms