RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 SEPT4O43236 478 aa13.56□□□□□ -0.24
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CTIF-202ENST00000382998 SKP1P63208 163 aa13.56□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
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CTIF-202ENST00000382998 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa13.56□□□□□ -0.24
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CTIF-202ENST00000382998 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.243e-7■■■□□ 16.8
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CTIF-202ENST00000382998 FAM83DQ9H4H8 585 aa13.55□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.55□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa13.55□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 KERAO60938 352 aa13.55□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 TMEM253P0C7T8 217 aa13.55□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 GM2AP17900 193 aa13.55□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 PTPN6P29350 595 aa13.55□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 SDC4P31431 198 aa13.55□□□□□ -0.24
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