RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PRR23AA6NEV1 266 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CFAP99D6REC4 459 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 HDAC3O15379 428 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ADH1BP00325 375 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 HOXB2P14652 356 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 EPHA3P29320 983 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R3AQ16821 1122 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TREML1Q86YW5 311 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GANCQ8TET4 914 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ELMO1Q92556 727 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SIKE1Q9BRV8 207 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 OR2AG1Q9H205 316 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB26Q9HCK0 441 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 FBXL12Q9NXK8 326 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CDYLQ9Y232 598 aa15.1■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TAPBPO15533 448 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TSPAN6O43657 245 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SNX2O60749 519 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CDK14O94921 469 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 DRD1P21728 446 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SERPINB5P36952 375 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 NCALDP61601 193 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CLCQ05315 142 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 FRA10AC1Q70Z53 315 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 NLRP8Q86W28 1048 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CD248Q9HCU0 757 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TRAF6Q9Y4K3 522 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 KRT87PA6NCN2 255 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 FFAR2O15552 330 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TM7SF2O76062 418 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 FOXA1P55317 472 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 DPTQ07507 201 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 FGL2Q14314 439 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 GBX1Q14549 363 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TTLL9Q3SXZ7 439 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ANKS6Q68DC2 871 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF765Q7L2R6 523 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 FOXJ1Q92949 421 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 KCNA7Q96RP8 456 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC106Q9BWC9 280 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 MID1IP1Q9NPA3 183 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 CD93Q9NPY3 652 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 PCTPQ9UKL6 214 aa15.08■□□□□ 0.01
CASQ1-201ENST00000368078 E9PBE3 544 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 STX16O14662 325 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 KLHL41O60662 606 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 AP2A2O94973 939 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 GDF5P43026 501 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 PREPP48147 710 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 BTKQ06187 659 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 STARD3Q14849 445 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 SPDYAQ5MJ70 313 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 OR14C36Q8NHC7 312 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 DNASE1L2Q92874 299 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 LGR4Q9BXB1 951 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 NUDT4Q9NZJ9 180 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 KLHL42Q9P2K6 505 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 GULP1Q9UBP9 304 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 VTI1BQ9UEU0 232 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF225Q9UK10 706 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 OARD1Q9Y530 152 aa15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CASQ1-201ENST00000368078 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms