RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
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SGMS1-201ENST00000361543 RTP4Q96DX8 246 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 TAAR9Q96RI9 348 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 DDA1Q9BW61 102 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 ASB8Q9H765 288 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 POT1Q9NUX5 634 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 OCIAD1Q9NX40 245 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 PDP2Q9P2J9 529 aa7.52□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL3Q9UH77 587 aa7.52□□□□□ -1.21
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SGMS1-201ENST00000361543 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
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SGMS1-201ENST00000361543 STMND1H3BQB6 276 aa7.51□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 K7ENP7 123 aa7.51□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.51□□□□□ -1.21
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SGMS1-201ENST00000361543 CCL22O00626 93 aa7.51□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 PSMD3O43242 534 aa7.51□□□□□ -1.21
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SGMS1-201ENST00000361543 RHDQ02161 417 aa7.51□□□□□ -1.21
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SGMS1-201ENST00000361543 RSC1A1Q92681 617 aa7.51□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 ULK4Q96C45 1275 aa7.51□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 SGF29Q96ES7 293 aa7.51□□□□□ -1.21
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SGMS1-201ENST00000361543 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.51□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.51□□□□□ -1.21
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SGMS1-201ENST00000361543 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
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SGMS1-201ENST00000361543 MAST4O15021 2626 aa7.51□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 COL12A1Q99715 3063 aa7.5□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL33A6NCF5 533 aa7.5□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 MGAT4DA6NG13 374 aa7.5□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 AGAP14A8MT82 685 aa7.5□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP99D6REC4 459 aa7.5□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 TK2O00142 265 aa7.5□□□□□ -1.21
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