RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355560.4

CLK2-201, Transcript of CDC like kinase 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CLK2, Length 2,120 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2-201ENST00000355560 DLG3Q92796 817 aa25.27■■□□□ 1.64
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CLK2-201ENST00000355560 ERLEC1Q96DZ1 483 aa25.27■■□□□ 1.64
CLK2-201ENST00000355560 PPP1R16AQ96I34 528 aa25.27■■□□□ 1.64
CLK2-201ENST00000355560 THTPAQ9BU02 230 aa25.27■■□□□ 1.64
CLK2-201ENST00000355560 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CLK2-201ENST00000355560 PSMD11O00231 422 aa25.27■■□□□ 1.64
CLK2-201ENST00000355560 PIP5K1BO14986 540 aa25.27■■□□□ 1.64
CLK2-201ENST00000355560 ESRRBO95718 433 aa25.27■■□□□ 1.64
CLK2-201ENST00000355560 THRAP10827 490 aa25.27■■□□□ 1.64
CLK2-201ENST00000355560 GM2AP17900 193 aa25.27■■□□□ 1.64
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CLK2-201ENST00000355560 AOAHP28039 575 aa25.27■■□□□ 1.64
CLK2-201ENST00000355560 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.648e-8■■■□□ 17.3
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CLK2-201ENST00000355560 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
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CLK2-201ENST00000355560 SUN2Q9UH99 717 aa25.27■■□□□ 1.64
CLK2-201ENST00000355560 ZNF225Q9UK10 706 aa25.27■■□□□ 1.64
CLK2-201ENST00000355560 H0Y858 1186 aa25.26■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 PLK4O00444 970 aa25.26■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 WNT9AO14904 365 aa25.26■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 GIPC1O14908 333 aa25.26■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 TBX10O75333 385 aa25.26■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 VCLP18206 1134 aa25.26■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 EP400NLQ6ZTU2 488 aa25.26■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 FAM161BQ96MY7 647 aa25.26■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 ACOX2Q99424 681 aa25.26■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 EGFL8Q99944 293 aa25.26■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 GPC4O75487 556 aa25.25■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 EPHX1P07099 455 aa25.25■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 ADRB3P13945 408 aa25.25■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 ELP6Q0PNE2 266 aa25.25■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 BTN2A2Q8WVV5 523 aa25.25■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 TUBB1Q9H4B7 451 aa25.25■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa25.25■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 HCN2Q9UL51 889 aa25.25■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 TIMM22Q9Y584 194 aa25.25■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 LRRK1Q38SD2 2015 aa25.25■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 TM7SF2O76062 418 aa25.25■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 OR52B6Q8NGF0 335 aa25.25■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 VPS35Q96QK1 796 aa25.25■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 BTRCQ9Y297 605 aa25.25■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 SCUBE1Q8IWY4 988 aa25.24■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 ULK2Q8IYT8 1036 aa25.24■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 NRSN1Q8IZ57 195 aa25.24■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa25.24■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 GLYATL1Q969I3 302 aa25.24■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 ZNF382Q96SR6 550 aa25.24■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 HSPA7P48741 367 aa25.24■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 RAP1GDS1P52306 607 aa25.24■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 SQLEQ14534 574 aa25.24■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 GBX1Q14549 363 aa25.24■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa25.24■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa25.24■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 PRSS16Q9NQE7 514 aa25.24■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 TAPBPO15533 448 aa25.23■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 SGTAO43765 313 aa25.23■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 ENTPD5O75356 428 aa25.23■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 AP2A2O94973 939 aa25.23■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 ITGAXP20702 1163 aa25.23■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 HERC3Q15034 1050 aa25.23■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 LDLRAP1Q5SW96 308 aa25.23■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 TDHQ8IZJ6 230 aa25.23■■□□□ 1.63
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