RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCAF1Q9Y4C2 921 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF5CO60282 957 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL4P13236 92 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADRA1DP25100 572 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC5A2P31639 672 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACVR1Q04771 509 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR18Q14330 331 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPE65Q16518 533 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNE4Q8WWG9 221 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCSTNQ92542 709 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF778Q96MU6 729 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL33A6NCF5 533 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPSB2P20231 275 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPK10P53779 464 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLE3Q04726 772 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAMB3Q13751 1172 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPSAB1Q15661 275 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP1B1Q16678 543 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF534Q76KX8 674 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 JAMLQ86YT9 394 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 HM13Q8TCT9 377 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 RMDN2Q96LZ7 410 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 WWP1Q9H0M0 922 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX12Q9UMY4 172 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEF10O60809 474 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBXN7O94888 489 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOT2P00505 430 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS41P49754 854 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 GFERP55789 205 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITIH4Q14624 930 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNAP47Q5SQN1 464 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 AFTPHQ6ULP2 937 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLRP9Q7RTR0 991 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLDN19Q8N6F1 224 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGBL5Q8NDL9 886 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTRT1Q8TDG2 376 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 RSC1A1Q92681 617 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEX13Q92968 403 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP7Q93009 1102 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDAC10Q969S8 669 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMEPA1Q969W9 287 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXJ2Q9P0K8 574 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACSL6Q9UKU0 697 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACSL5Q9ULC5 683 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS21Q9Y6M0 314 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf172C9J069 976 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 NVLO15381 856 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT14P02533 472 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9P02748 559 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35G4P0C7Q5 338 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 TYRP1P17643 537 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 COILP38432 576 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPZBP47756 277 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRADDP78560 199 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNJ11Q14654 390 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCID2Q5JVF3 399 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PACS1Q6VY07 963 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 COG4Q9H9E3 785 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL3Q9UH77 587 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PYCARDQ9ULZ3 195 aa19.13■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDK2Q58EX2 2172 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 A8MU76 341 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CES2O00748 559 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF185O15231 689 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHF2O75151 1096 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP2A2O94973 939 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLBP06746 335 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSG1P42857 185 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEA6P43360 314 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPS1Q13098 491 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLN3Q13286 438 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDZD3Q86UT5 571 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLXDC1Q8IUK5 500 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP206Q8IYR0 622 aa19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms