RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 SUPT7LO94864 414 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 GLULP15104 373 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 C5AR1P21730 350 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 GATA4P43694 442 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SOX9P48436 509 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMD8P48556 350 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 RASSF2P50749 326 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 HERVK_113P63132 956 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 RALGDSQ12967 914 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 TSNQ15631 228 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 PFKFB4Q16877 469 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SPDYAQ5MJ70 313 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC44A3Q8N4M1 653 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 DDHD1Q8NEL9 900 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 COQ10AQ96MF6 247 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS35Q96QK1 796 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCG8Q9H221 673 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNK12Q9HB15 430 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCF3Q9NUQ8 709 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 PNPOQ9NVS9 261 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP69BQ9UJL9 534 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 SORCS3Q9UPU3 1222 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 GBF1Q92538 1859 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGGTB-201ENST00000319942 NEMP2A6NFY4 417 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TRPC5OSA6NMA1 111 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC7O00311 574 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 STX16O14662 325 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HDAC3O15379 428 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MMP20O60882 483 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN12O95859 305 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FTH1P02794 183 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 EPXP11678 715 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGB6P18564 788 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNA5P22460 613 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 WASP42768 502 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SATB1Q01826 763 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CREB5Q02930 508 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CNTN1Q12860 1018 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4D1Q15615 310 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CST6Q15828 149 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GALNTL6Q49A17 601 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf27AQ580R0 203 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 METTL21CQ5VZV1 264 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SEL1L3Q68CR1 1132 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKS6Q68DC2 871 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FRA10AC1Q70Z53 315 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CPNE9Q8IYJ1 553 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 DNASE1L2Q92874 299 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GLYATL1Q969I3 302 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ERP27Q96DN0 273 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 DTD2Q96FN9 168 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC30A3Q99726 388 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SAR1AQ9NR31 198 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CD274Q9NZQ7 290 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HAO1Q9UJM8 370 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HCN2Q9UL51 889 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 UBXN8O00124 270 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MATN2O00339 956 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GIPC1O14908 333 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HGSO14964 777 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 RAD51BO15315 384 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 AP1G1O43747 822 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 KLK8O60259 260 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms