RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 METTL4Q8N3J2 472 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PLXNB1O43157 2135 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CCNB1P14635 433 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ERVK-8P63133 956 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 OR6J1Q8NGC5 347 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 OR51D1Q8NGF3 324 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 BTN3A1O00481 513 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC22A3O75751 556 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM189A2Q15884 450 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MFSD2AQ8NA29 543 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 HSPBAP1Q96EW2 488 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 K7EPK0 472 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MICAL2O94851 1124 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MLYCDO95822 493 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF20P17024 532 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PPP3CAQ08209 521 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CUL2Q13617 745 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 LIN52Q52LA3 116 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TMC8Q8IU68 726 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 BBIP1A8MTZ0 92 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FOXO6A8MYZ6 492 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ISM1B1AKI9 464 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FADDQ13158 208 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SELENOMQ8WWX9 145 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 OR52E6Q96RD3 313 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 F8W036 122 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC2A5P22732 501 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 RNF4P78317 190 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 BLOC1S1P78537 153 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CBWD1Q9BRT8 395 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CXorf21Q9HAI6 301 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ARL8BQ9NVJ2 186 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 USP31Q70CQ4 1352 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CAPN8A6NHC0 703 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TNFRSF8P28908 595 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC3A1Q07837 685 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 AADACL2Q6P093 401 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 KCNV1Q6PIU1 500 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC9B2Q86UD5 537 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PANX3Q96QZ0 392 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MTMR12Q9C0I1 747 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CFL2Q9Y281 166 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 AVILO75366 819 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 OR56A5P0C7T3 313 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 GNMTQ14749 295 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ALKBH2Q6NS38 261 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM53Q6P2H8 277 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ACMSDQ8TDX5 336 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 LRFN1Q9P244 771 aa11.06□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TOR1BO14657 336 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ENTPD6O75354 484 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CABYRO75952 493 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PPIL2Q13356 520 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TLR1Q15399 786 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 GALNT7Q86SF2 657 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 DENND1CQ8IV53 801 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 STK40Q8N2I9 435 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 KCNH7Q9NS40 1196 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ICKQ9UPZ9 632 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 DNAJA2O60884 412 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ACADMP11310 421 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PPIBP23284 216 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 HMGXB4Q9UGU5 601 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PIP5K1CO60331 668 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 H6PDO95479 791 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 NOMO3P69849 1222 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CDC42EP1Q00587 391 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 NOMO1Q15155 1222 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM13CQ8NE31 585 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SEMA6BQ9H3T3 888 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CDH1P12830 882 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 JUNDP17535 347 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CXCR2P25025 360 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ETV5P41161 510 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC1A2P43004 574 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CAPZA1P52907 286 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SVOPLQ8N434 492 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 KCTD7Q96MP8 289 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC30A2Q9BRI3 323 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms