RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 G3V2T6 193 aa20■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 WWP2O00308 870 aa20■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 HLA-DQB2P05538 268 aa20■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 NR2F6P10588 404 aa20■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 APLP1P51693 650 aa20■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 AHI1Q8N157 1196 aa20■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 SIX5Q8N196 739 aa20■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 SIPA1Q96FS4 1042 aa20■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 TDP1Q9NUW8 608 aa20■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 H0YC42 278 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 RCVRNP35243 200 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 SLC10A7Q0GE19 358 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 ATP1A4Q13733 1029 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 XKR4Q5GH76 650 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 RPTNQ6XPR3 784 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 HBEGFQ99075 208 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 SH3GL2Q99962 352 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 NECTIN3Q9NQS3 549 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 NR2E1Q9Y466 385 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 U3KQV3 271 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 KCNQ1P51787 676 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 ZBTB6Q15916 424 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 HEATR4Q86WZ0 1026 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 UBR7Q8N806 425 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 OR10H5Q8NGA6 315 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 OR13C4Q8NGS5 318 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 MKL2Q9ULH7 1088 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 ELOVL7A1L3X0 281 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 IL1R2P27930 398 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 ZNF730Q6ZMV8 503 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 ZNF461Q8TAF7 563 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 HMG20AQ9NP66 347 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 VARSP26640 1264 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 CYP4F3Q08477 520 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 C11orf65Q8NCR3 313 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 EPB41L1Q9H4G0 881 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 KERAO60938 352 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 POMZP3Q6PJE2 187 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 OR2AP1Q8NGE2 309 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 SMOC2Q9H3U7 446 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 GALNT8Q9NY28 637 aa19.99■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 SLC39A4Q6P5W5 647 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 SLC35F5Q8WV83 523 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 SH3GLB1Q9Y371 365 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 C2orf71A6NGG8 1288 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 FGF18O76093 207 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 PRKCGP05129 697 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 SAGP10523 405 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 CYP4B1P13584 511 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 PRR5P85299 388 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 CYP1B1Q16678 543 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 BRAT1Q6PJG6 821 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 HFE2Q6ZVN8 426 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 BEND5Q7L4P6 421 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 CNTD1Q8N815 330 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 SLC35B2Q8TB61 432 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 BPIFB1Q8TDL5 484 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 CNPPD1Q9BV87 410 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 PNPLA3Q9NST1 481 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 SPATA2Q9UM82 520 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 SLC35G1Q2M3R5 365 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 OSTM1Q86WC4 334 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 ESAMQ96AP7 390 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 EHD3Q9NZN3 535 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 TULP2O00295 520 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 NPHS1O60500 1241 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 RALGDSQ12967 914 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 PIK3C3Q8NEB9 887 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 FAM192AQ9GZU8 254 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 HS3ST4Q9Y661 456 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 HNMTP50135 292 aa19.97■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 FOXM1Q08050 763 aa19.97■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 TAB1Q15750 504 aa19.97■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 ZSWIM7Q19AV6 140 aa19.97■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 TCEAL5Q5H9L2 206 aa19.97■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 ENPP7Q6UWV6 458 aa19.97■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 MCEMP1Q8IX19 187 aa19.97■□□□□ 0.79
USP25-202ENST00000285681 LIX1Q8N485 282 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms