RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283351.8

TRAPPC8-201, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC8, Length 6,226 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-201ENST00000283351 ENPEPQ07075 957 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 ADRM1Q16186 407 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CHST4Q8NCG5 386 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 GPR174Q9BXC1 333 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 A0A075B6Q4 140 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 PGM3O95394 542 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CBX6O95503 412 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 MNDAP41218 407 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 IL10RBQ08334 325 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CUZD1Q86UP6 607 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 GHDCQ8N2G8 530 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 IL7RP16871 459 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 CD247P20963 164 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 PSME3P61289 254 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SNTA1Q13424 505 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ADGRF1Q5T601 910 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ARMC3Q5W041 872 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TPST2O60704 377 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 FAM153BP0C7A2 387 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 NSG1P42857 185 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 MAPK14Q16539 360 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 C10orf107Q8IVU9 208 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SAMD11Q96NU1 681 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 RHOJQ9H4E5 214 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 MATN3O15232 486 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 PI15O43692 258 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 CCNOP22674 350 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TMEM192Q8IY95 271 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 EHD3Q9NZN3 535 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 U3KQV3 271 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TLR1Q15399 786 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 AADATQ8N5Z0 425 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TERB1Q8NA31 727 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ARMC5Q96C12 935 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SERPINA1P01009 418 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 L1CAMP32004 1257 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 CCNFP41002 786 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC6A9P48067 706 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 HCAR3P49019 387 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SNX33Q8WV41 574 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 A0A0U1RQF3 1178 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 IFNA6P05013 189 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 MPP1Q00013 466 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 COQ8BQ96D53 544 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ALPIP09923 528 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 CHN2P52757 468 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ARHGAP1Q07960 439 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 MEA1Q16626 185 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms