RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 NKAIN2Q5VXU1 208 aa21.83■■□□□ 1.09
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SYF2-201ENST00000236273 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 GPR150Q8NGU9 434 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 HM13Q8TCT9 377 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
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SYF2-201ENST00000236273 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 ERP44Q9BS26 406 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 P2RY12Q9H244 342 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 SLC40A1Q9NP59 571 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 SAMD15Q9P1V8 674 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 ACSL5Q9ULC5 683 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa21.83■■□□□ 1.09
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SYF2-201ENST00000236273 TUBB4AP04350 444 aa21.82■■□□□ 1.08
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SYF2-201ENST00000236273 SPIDRQ14159 915 aa21.82■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 DUPD1Q68J44 220 aa21.82■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 MAATS1Q7Z4T9 603 aa21.82■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 ZNF592Q92610 1267 aa21.82■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 DEPDC7Q96QD5 511 aa21.82■■□□□ 1.08
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SYF2-201ENST00000236273 WWP1Q9H0M0 922 aa21.82■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 OR52A5Q9H2C5 316 aa21.82■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 COG4Q9H9E3 785 aa21.82■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 UCK1Q9HA47 277 aa21.82■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 FAM8A1Q9UBU6 413 aa21.82■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 SMAPO00193 183 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 POLBP06746 335 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 PDHA2P29803 388 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 TTPAP49638 278 aa21.81■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 TYSND1Q2T9J0 566 aa21.81■■□□□ 1.08
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SYF2-201ENST00000236273 USP53Q70EK8 1073 aa21.81■■□□□ 1.08
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SYF2-201ENST00000236273 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.81■■□□□ 1.08
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SYF2-201ENST00000236273 BIRC8Q96P09 236 aa21.8■■□□□ 1.08
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SYF2-201ENST00000236273 BIRC2Q13490 618 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 TRADDQ15628 312 aa21.8■■□□□ 1.08
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SYF2-201ENST00000236273 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 FOXP3Q9BZS1 431 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 SEMA6CQ9H3T2 930 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 WHRNQ9P202 907 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 TEX264Q9Y6I9 313 aa21.8■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 IGF2RP11717 2491 aa21.79■■□□□ 1.08
SYF2-201ENST00000236273 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa21.79■■□□□ 1.08
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