RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 NSMCE3Q96MG7 304 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 OSBPL10Q9BXB5 764 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MARCH2Q9P0N8 246 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJB9Q9UBS3 223 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SEPT3Q9UH03 358 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ERGIC3Q9Y282 383 aa21.84■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 K7EPI3 171 aa21.83■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 NIPSNAP2O75323 286 aa21.83■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 BCAP31P51572 246 aa21.83■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 PLA2G16P53816 162 aa21.83■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MIB1Q86YT6 1006 aa21.83■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 FKBP10Q96AY3 582 aa21.83■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 LINGO1Q96FE5 620 aa21.83■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MBOAT4Q96T53 435 aa21.83■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa21.83■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 J3QRK9 145 aa21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 LSM1O15116 133 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 PCNAP12004 261 aa21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 JAK1P23458 1154 aa21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 NR1D2Q14995 579 aa21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 C6orf141Q5SZD1 244 aa21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 GALNT18Q6P9A2 607 aa21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXL8Q96CD0 374 aa21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 CDK15Q96Q40 435 aa21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 ADNPQ9H2P0 1102 aa21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEE1Q9HCI5 957 aa21.83■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 GRK4P32298 578 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 HTR6P50406 440 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 CLCN4P51793 760 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 MLLT10P55197 1068 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP2R2BQ00005 443 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 NADSYN1Q6IA69 706 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 GRAMD4Q6IC98 578 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 PIANPQ8IYJ0 282 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 SDCCAG3Q96C92 435 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 PSKH2Q96QS6 385 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 RAD21L1Q9H4I0 556 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 NUDT4Q9NZJ9 180 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 CPA4Q9UI42 421 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 C2orf81A6NN90 581 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 CFAP99D6REC4 459 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 GMNNO75496 209 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 CAPN1P07384 714 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 HTR1AP08908 422 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 IL7RP16871 459 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 NFKBIAP25963 317 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 NIPAL1Q6NVV3 410 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 METTL6Q8TCB7 284 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC12A8A0AV02 714 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 INPPL1O15357 1258 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 HMBSP08397 361 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 TTPAP49638 278 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 DGKQP52824 942 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 FKBP1BP68106 108 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 RING1Q06587 406 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 IL27RAQ6UWB1 636 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 SVOPLQ8N434 492 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM86B1Q8N7N1 296 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 OR52E4Q8NGH9 312 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 SGCDQ92629 289 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNJ9Q92806 393 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 RMDN1Q96DB5 314 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAM2Q99965 735 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 PDE10AQ9Y233 779 aa21.82■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 SERPINB7O75635 380 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 PRLP01236 227 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 IGHA2P01877 340 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEA11P43364 429 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 GSTM4Q03013 218 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 BFSP2Q13515 415 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 PFDN6O15212 129 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D4O60343 1298 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 OR1I1O60431 355 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 KATNA1O75449 491 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJB5O75953 348 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNH1O95259 989 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 TACR2P21452 398 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 CCR3P51677 355 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 GNA12Q03113 381 aa21.81■■□□□ 1.08
HTATSF1-201ENST00000218364 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms