RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nr2f1Q60632 422 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc6a4Q60857 630 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Orai3Q6P8G8 290 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prrt3Q6PE13 971 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 2700097O09RikQ6PGK3 301 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clec2eQ80XD9 204 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TiprlQ8BH58 271 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NapepldQ8BH82 396 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr525Q8VGL5 309 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc9bQ9D6E4 239 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nrf1Q9WU00 503 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2-BlV9GXR0 257 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myh7Q91Z83 1935 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grin3aA2AIR5 1135 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r55E9Q8I6 310 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3642K7N6V4 267 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DldO08749 509 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stat6P52633 837 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RabggtbP53612 339 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 OsgepQ8BWU5 335 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zhx3Q8C0Q2 951 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ThtpaQ8JZL3 224 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Polr1eQ8K202 482 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trhr2Q9ERT2 382 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Carm1Q9WVG6 608 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Man1b1A2AJ15 658 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fibcd1A2AV25 459 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp6ap1lD3Z5W0 336 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akain1G3UWD5 69 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bmpr1aP36895 532 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp46P62069 366 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C1orf109Q499E6 217 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vps72Q62481 368 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phf24Q80TL4 400 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbbp8Q80YR6 893 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc28bQ8CEG5 200 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc59Q8R2N0 240 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hbp1Q8R316 516 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1311Q8VET0 312 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abcg4Q91WA9 646 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Actrt1Q9D9J3 376 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smpd3Q9JJY3 655 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 VapbQ9QY76 243 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fads2Q9Z0R9 444 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtm1Q9Z2C5 603 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clec2lP0C7M9 211 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd40lgP27548 260 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt76Q3UV17 594 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bcl2a1bQ497M6 172 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cxcl17Q5UW37 119 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phf21aQ6ZPK0 659 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AptxQ7TQC5 342 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8CDN1 933 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dclre1cQ8K4J0 705 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AdprmQ99KS6 340 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cngb3Q9JJZ9 694 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxe3Q9QY14 288 aa12.67□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1480A0A140LIR8 359 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1600015I10RikE9Q745 711 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc16a8O35308 492 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CflarO35732 481 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnase1l3O55070 310 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 StacP97306 403 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ap5b1Q3TAP4 876 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 StradaQ3UUJ4 431 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2-M10.2Q85ZW9 329 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Shc2Q8BMC3 573 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mcoln3Q8R4F0 553 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rrp8Q9DB85 457 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NagaQ9QWR8 415 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bscl2Q9Z2E9 383 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Epb41l1Q9Z2H5 879 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sirpb1aA0A0A6YYP6 397 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A0A286YCD0 109 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GzmkO35205 263 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GnazO70443 355 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mpp1P70290 466 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rrm2bQ6PEE3 351 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1128Q7TR47 311 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr765Q7TRI6 309 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MogsQ80UM7 834 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ap5m1Q8BJ63 490 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sumf2Q8BPG6 308 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr767Q8VG33 309 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lsm12Q9D0R8 195 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndst3Q9EQH7 873 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf536Q8K083 1302 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm28961A0A087WPA5 222 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21858A0A087WQ24 222 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SelenonD3Z2R5 557 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr95D3Z7A8 784 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf683I7HJS4 458 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rtn2O70622 471 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Actr1aP61164 376 aa12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29 ms