RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 TFEBP19484 476 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DRD4P21917 467 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ITGA3P26006 1051 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 RBL1P28749 1068 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 NDST1P52848 882 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ARF5P84085 180 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 BST1Q10588 318 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MIB1Q86YT6 1006 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FTMTQ8N4E7 242 aa6.3□□□□□ -1.4
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SCN2A-209ENST00000636071 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
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SCN2A-209ENST00000636071 BRD9Q9H8M2 597 aa6.3□□□□□ -1.4
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SCN2A-209ENST00000636071 LRRC42Q9Y546 428 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FABP12A6NFH5 140 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.3□□□□□ -1.4
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SCN2A-209ENST00000636071 TIPRLO75663 272 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 C22orf31O95567 290 aa6.3□□□□□ -1.4
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SCN2A-209ENST00000636071 ESR1P03372 595 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CCNB1P14635 433 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ADH6P28332 368 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SCNN1AP37088 669 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 BLKP51451 505 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MAPK12P53778 367 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TAS2R50P59544 299 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MOGQ16653 247 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CES5AQ6NT32 575 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FAM131BQ86XD5 332 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CREG2Q8IUH2 290 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.3□□□□□ -1.4
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SCN2A-209ENST00000636071 OR52B2Q96RD2 323 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CIPCQ9C0C6 399 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.3□□□□□ -1.4
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SCN2A-209ENST00000636071 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 QRICH2Q9H0J4 1663 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PHYHO14832 338 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PRNPP04156 253 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 RARAP10276 462 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FGFR3P22607 806 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CMPK1P30085 196 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SLC7A1P30825 629 aa6.3□□□□□ -1.4
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SCN2A-209ENST00000636071 KCNK18Q7Z418 384 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GPAT4Q86UL3 456 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CASZ1Q86V15 1759 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ITFG2Q969R8 447 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SLC35C1Q96A29 364 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TAMM41Q96BW9 452 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 APBA2Q99767 749 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.3□□□□□ -1.4
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SCN2A-209ENST00000636071 FKBP7Q9Y680 259 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DISP1Q96F81 1524 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 LINGO3P0C6S8 592 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SRCP12931 536 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FOSL1P15407 271 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 BACE1P56817 501 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 OCLNQ16625 522 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.3□□□□□ -1.4
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SCN2A-209ENST00000636071 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.3□□□□□ -1.4
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SCN2A-209ENST00000636071 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.3□□□□□ -1.4
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SCN2A-209ENST00000636071 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.3□□□□□ -1.4
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SCN2A-209ENST00000636071 NRCAMQ92823 1304 aa6.3□□□□□ -1.4
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