RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ROPN1L	Q96C74	230 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF599	Q96NL3	588 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RAD9A	Q99638	391 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TIMM22	Q9Y584	194 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KRT6A	P02538	564 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LRG1	P02750	347 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KRT6B	P04259	564 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GPI	P06744	558 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ADH1A	P07327	375 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MPST	P25325	297 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LIMK2	P53671	638 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MAX	P61244	160 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC12A1	Q13621	1099 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CHST9	Q7L1S5	443 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MFSD3	Q96ES6	412 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RBBP8	Q99708	897 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SIAE	Q9HAT2	523 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DHRS12	A0PJE2	317 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TIMM44	O43615	452 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ASNA1	O43681	348 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TSPAN3	O60637	253 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	LATS1	O95835	1130 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	NMBR	P28336	390 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ETFB	P38117	255 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CD86	P42081	329 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GABARAPL2	P60520	117 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	DSC2	Q02487	901 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	REP15	Q6BDI9	236 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PELI3	Q8N2H9	469 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PGBD5	Q8N414	524 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	OR7D4	Q8NG98	312 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SLC22A12	Q96S37	553 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	FANCE	Q9HB96	536 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PDF	Q9HBH1	243 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		15.14	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659		A0A0D9SEW6	157 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	IDH3B	O43837	385 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PIGN	O95427	931 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	OLFM2	O95897	454 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	MMP2	P08253	660 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	HDC	P19113	662 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GABRR2	P28476	465 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SGSH	P51688	502 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	POU6F1	Q14863	301 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PCSK7	Q16549	785 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TXNDC8	Q6A555	127 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	IL31	Q6EBC2	164 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	KCNMB4	Q86W47	210 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SNX19	Q92543	992 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CEP44	Q9C0F1	390 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PSAT1	Q9Y617	370 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1B0GVM2	712 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ACOX3	O15254	700 aa		15.13	■□□□□ 0.01
BBS1-225	ENST00000630659	C8A	P07357	584 aa		15.13	■□□□□ 0.01

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