RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628509.1

FOXCUT-201, FOXC1 upstream transcript, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FOXCUT, Length 333 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXCUT-201ENST00000628509 SHISA7A6NL88 538 aa9.98□□□□□ -0.81
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