RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM124AQ86V42 546 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 STAG3L4Q8TBR4 150 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 HIC2Q96JB3 615 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC17A9Q9BYT1 436 aa24.52■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2AG2A6NM03 316 aa24.51■■□□□ 1.51
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CAPNS1-215ENST00000628018 KERAO60938 352 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 FTH1P02794 183 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 PCCBP05166 539 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 PRLHRP49683 370 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 GBX1Q14549 363 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ACSBG2Q5FVE4 666 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 CGB2Q6NT52 195 aa24.51■■□□□ 1.51
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM74Q86UV6 250 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ASB12Q8WXK4 309 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf42Q9NWW7 574 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 EBF1Q9UH73 591 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 BTN3A1O00481 513 aa24.51■■□□□ 1.51
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CAPNS1-215ENST00000628018 KLK6Q92876 244 aa24.51■■□□□ 1.51
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CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC126Q96EE4 140 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 C7orf26Q96N11 449 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 C20orf27Q9GZN8 174 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 NEMP2A6NFY4 417 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 A8MT66 165 aa24.5■■□□□ 1.51
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CAPNS1-215ENST00000628018 KPNA5O15131 536 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK14O94921 469 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV3-19P01714 112 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM23P36406 574 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJB13P59910 316 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP2CBP62714 309 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP2CAP67775 309 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK3Q00526 305 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 BCL7AQ4VC05 210 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 CYHR1Q6ZMK1 362 aa24.5■■□□□ 1.51
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CAPNS1-215ENST00000628018 TEX101Q9BY14 249 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 BTBD1Q9H0C5 482 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2AG1Q9H205 316 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 THAP1Q9NVV9 213 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ATXN10Q9UBB4 475 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 NUMA1Q14980 2115 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 VEGFDO43915 354 aa24.49■■□□□ 1.51
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CAPNS1-215ENST00000628018 MTHFD2P13995 350 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ASPHQ12797 758 aa24.49■■□□□ 1.51
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM220Q6QAJ8 160 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO1HQ8N1T3 1032 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 PGBD3Q8N328 593 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2T34Q8NGX1 318 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 SGK2Q9HBY8 427 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF112Q9ULX5 631 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD51BO15315 384 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ITM2AO43736 263 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 LILRB5O75023 590 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TPBGLP0DKB5 382 aa24.48■■□□□ 1.51
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CAPNS1-215ENST00000628018 NFKB2Q00653 900 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM69Q86WT6 500 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A9Q8IVM8 553 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 CCM2Q9BSQ5 444 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D17Q9HA65 648 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 DOCK9Q9BZ29 2069 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 SYCE1LA8MT33 242 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM114B3SHH9 223 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf142B7Z368 130 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 UBXN8O00124 270 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 NUAK1O60285 661 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX3O60493 162 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM24O75264 130 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ARRB2P32121 409 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 NAGLUP54802 743 aa24.47■■□□□ 1.51
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