RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 GDAP2Q9NXN4 497 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF226Q9NYT6 803 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF69Q9UC07 566 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 EGFL7Q9UHF1 273 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 LRRC72A6NJI9 287 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CLDN25C9JDP6 229 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ACKR2O00590 384 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TBX1O43435 398 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 FSBPO95073 299 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 HRGP04196 525 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 RPS2P15880 293 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CHMP24386 653 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PRKCHP24723 683 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ACSL1P33121 698 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 MAPK12P53778 367 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PNLIPRP1P54315 467 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 HERVK_113P62684 666 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC13A2Q13183 592 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CBLBQ13191 982 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 DNASE1L3Q13609 305 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ELOA3BQ3SY89 546 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 KLHL22Q53GT1 634 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 MTX3Q5HYI7 312 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SMARCD3Q6STE5 483 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZPBP2Q6X784 338 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF101Q8IZC7 436 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ELOA3Q8NG57 546 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 OR7D4Q8NG98 312 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SPATA22Q8NHS9 363 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SMARCD2Q92925 531 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 BORCS7Q96B45 105 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZFP3Q96NJ6 502 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PSKH2Q96QS6 385 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 FTHL17Q9BXU8 183 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SPATC1LQ9H0A9 340 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TM9SF3Q9HD45 589 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PCDH10Q9P2E7 1040 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 DNAJC5BQ9UF47 199 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ERVW-1Q9UQF0 538 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 DGKBQ9Y6T7 804 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ADGRL2O95490 1459 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 DAPL1A0PJW8 107 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM150CB9EJG8 249 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PLD2O14939 933 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TLL1O43897 1013 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ITGB1P05556 798 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC6A4P31645 630 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CRISP1P54107 249 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ERVK-21P61565 698 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 FOXO4P98177 505 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SP2Q02086 613 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TLE2Q04725 743 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 MXD1Q05195 221 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SNTA1Q13424 505 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 MLC1Q15049 377 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TIGD2Q4W5G0 525 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 BRMS1LQ5PSV4 323 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 MED27Q6P2C8 311 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 COMTD1Q86VU5 262 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PAQR7Q86WK9 346 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZBTB2Q8N680 514 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF676Q8N7Q3 588 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC22A8Q8TCC7 542 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF398Q8TD17 642 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 HDAC7Q8WUI4 952 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 AZIN2Q96A70 460 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 C8orf48Q96LL4 319 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 APOLD1Q96LR9 279 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 GORASP1Q9BQQ3 440 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 OR51V1Q9H2C8 321 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TMLHEQ9NVH6 421 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TBCCD1Q9NVR7 557 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SPATA7Q9P0W8 599 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 FBXW2Q9UKT8 454 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 FADS3Q9Y5Q0 445 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 A0A0J9YYE9 177 aa4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms