RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 HRO43593 1189 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR1I1O60431 355 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 SNX2O60749 519 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 KERAO60938 352 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 NIPSNAP2O75323 286 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 SNNO75324 88 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 IPO13O94829 963 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ACADMP11310 421 aa16.56■□□□□ 0.24
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 SDHBP21912 280 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 FNTBP49356 437 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGAP8P85298 464 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 GSTM4Q03013 218 aa16.56■□□□□ 0.24
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TRAPPC3-210ENST00000617904 PON2Q15165 354 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa16.56■□□□□ 0.24
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CTSL3PQ5NE16 218 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 LAIR1Q6GTX8 287 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa16.56■□□□□ 0.24
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TRAPPC3-210ENST00000617904 DTD2Q96FN9 168 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAR2Q96K12 515 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR78Q96P69 363 aa16.56■□□□□ 0.24
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TRAPPC3-210ENST00000617904 LATS2Q9NRM7 1088 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 KCNK4Q9NYG8 393 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 SARDHQ9UL12 918 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAB23Q9ULC3 237 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
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TRAPPC3-210ENST00000617904 AREL1O15033 823 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 DNAJC6O75061 913 aa16.55■□□□□ 0.24
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TRAPPC3-210ENST00000617904 P2RY2P41231 377 aa16.55■□□□□ 0.24
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TRAPPC3-210ENST00000617904 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR1P46091 355 aa16.55■□□□□ 0.24
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TRAPPC3-210ENST00000617904 MESP2Q0VG99 397 aa16.55■□□□□ 0.24
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TRAPPC3-210ENST00000617904 KBTBD6Q86V97 674 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 HDDC3Q8N4P3 179 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCNYL1Q8N7R7 359 aa16.55■□□□□ 0.24
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CD200R1Q8TD46 325 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 GLYATL1Q969I3 302 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 VOPP1Q96AW1 172 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 COQ10AQ96MF6 247 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 GABRG3Q99928 467 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 DRC3Q9H069 523 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABCG8Q9H221 673 aa16.55■□□□□ 0.24
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TRAPPC3-210ENST00000617904 VTI1BQ9UEU0 232 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 CD84Q9UIB8 345 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAP2CQ9Y3L5 183 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
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TRAPPC3-210ENST00000617904 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 GIPC1O14908 333 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAD51BO15315 384 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 SUPT3HO75486 399 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 TM7SF2O76062 418 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCDH8O95206 1070 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 RETP07949 1114 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 C6P13671 934 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 DPTQ07507 201 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPEM2Q0P670 501 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 DLG1Q12959 904 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 IFT88Q13099 833 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 C2orf27AQ580R0 203 aa16.54■□□□□ 0.24
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