RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LPAR1	Q92633	364 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KRT35	Q92764	455 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STMN2	Q93045	179 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ASB3	Q9Y575	518 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CLUH	O75153	1309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYH1	P12882	1939 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CLIC1	O00299	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GYG2	O15488	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CLDN3	O15551	220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MED7	O43513	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AP1G1	O43747	822 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LIAS	O43766	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STRN	O43815	780 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EXTL3	O43909	919 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PEX11A	O75192	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SMIM24	O75264	130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KATNA1	O75449	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CIB2	O75838	187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KLHL2	O95198	593 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACSL3	O95573	720 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PIGR	P01833	764 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MT-ND3	P03897	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FGF2	P09038	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CETP	P11597	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC130	P13994	396 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CPA3	P15088	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CA4	P22748	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DNAJB1	P25685	340 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARFIP2	P53365	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RAD23B	P54727	409 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYL6	P60660	151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AP2B1	P63010	937 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CFHR3	Q02985	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CYP24A1	Q07973	514 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAB1	Q13506	487 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TFDP2	Q14188	446 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PSMD6	Q15008	389 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TAZ	Q16635	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAPK6	Q16659	721 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPD1L	Q8N335	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NME8	Q8N427	588 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms