RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNAO1P09471 354 aa11.64□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CA8P35219 290 aa11.64□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RIN3Q8TB24 985 aa11.64□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYO19Q96H55 970 aa11.64□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABRAXAS2Q15018 415 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHKG1Q16816 387 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa11.63□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NANOGQ9H9S0 305 aa11.63□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IPPKQ9H8X2 491 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAGEE1Q9HCI5 957 aa11.63□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VILLO15195 856 aa11.63□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NFATC2Q13469 925 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GTF2H2Q13888 395 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NR6A1Q15406 480 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SGO1Q5FBB7 561 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BBS7Q8IWZ6 715 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM199Q8N511 208 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZFP28Q8NHY6 868 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEPHS2Q99611 448 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACTL8Q9H568 366 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF696Q9H7X3 374 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARMC1Q9NVT9 282 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HACD3Q9P035 362 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACTR3BQ9P1U1 418 aa11.63□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAPBPO15533 448 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CKMP06732 381 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BMP2P12643 396 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BPIP17213 487 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD70P32970 193 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
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