RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598444.1

ARHGEF1-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARHGEF1, Length 425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF1-215ENST00000598444 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 ACTL9Q8TC94 416 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF398Q8TD17 642 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 PANX2Q96RD6 677 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 FICDQ9BVA6 458 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 OSBPL8Q9BZF1 889 aa8.7□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.7□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 MACROD2A1Z1Q3 448 aa8.69□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 NKX2-8O15522 239 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 KCNN4O15554 427 aa8.69□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 MSH3P20585 1137 aa8.69□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 CACHD1Q5VU97 1274 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 IRGCQ6NXR0 463 aa8.69□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 RANBP10Q6VN20 620 aa8.69□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.69□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 RNF31Q96EP0 1072 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.69□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 ASB8Q9H765 288 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 STARD5Q9NSY2 213 aa8.69□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 PTPN13Q12923 2485 aa8.69□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 C5orf60A6NFR6 353 aa8.68□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 CAPZBP47756 277 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 SH3BP2P78314 561 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 NFKB2Q00653 900 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 DMPKQ09013 629 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 NFE2L1Q14494 772 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF1-215ENST00000598444 IL11RAQ14626 422 aa8.68□□□□□ -1.02
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ARHGEF1-215ENST00000598444 AADACL2Q6P093 401 aa8.68□□□□□ -1.02
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