RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC126Q96EE4 140 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 HHIPQ96QV1 700 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 EPN3Q9H201 632 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR26Q9H7D7 661 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 MANSC1Q9H8J5 431 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CD93Q9NPY3 652 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 COL6A3P12111 3177 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP192Q8TEP8 1941 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 GMNCA6NCL1 334 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 TK2O00142 265 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 LATO43561 262 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 TAC1P20366 129 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT1P36639 197 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CCR5P51681 352 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 SIGLEC14Q08ET2 396 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 DET1Q7L5Y6 550 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA6LQ8N4H0 392 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 STAG3L4Q8TBR4 150 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 LINGO1Q96FE5 620 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CHMP6Q96FZ7 201 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CD320Q9NPF0 282 aa30.57■■■□□ 2.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf42Q9NWW7 574 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR91A4D1P6 747 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 G3V2L1 256 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ASPHQ12797 758 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 INPP5AQ14642 412 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ATG16L1Q676U5 607 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB14O43829 449 aa30.55■■■□□ 2.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 ITGB6P18564 788 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CD6P30203 668 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ALDH3A1P30838 453 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CCR7P32248 378 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 GBX1Q14549 363 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM220Q6QAJ8 160 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 MYO1HQ8N1T3 1032 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ASZ1Q8WWH4 475 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 KLK6Q92876 244 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CCM2Q9BSQ5 444 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2AG1Q9H205 316 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ATXN10Q9UBB4 475 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP8B1Q9UNU6 501 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIOO75962 3097 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2AG2A6NM03 316 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 MECRQ9BV79 373 aa30.54■■■□□ 2.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 OXSMQ9NWU1 459 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 EML5Q05BV3 1969 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 SYCE1LA8MT33 242 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 TOR1BO14657 336 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 KERAO60938 352 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 GRK2P25098 689 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 IGFALSP35858 605 aa30.53■■■□□ 2.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 NEK10Q6ZWH5 1172 aa30.53■■■□□ 2.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 TCP11X1B4DZS4 312 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CHUKO15111 745 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC31A1O15431 190 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 NUAK1O60285 661 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM13O60858 407 aa30.52■■■□□ 2.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM74Q86UV6 250 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A9Q8IVM8 553 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf107Q8IVU9 208 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 NAT14Q8WUY8 206 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ELMO1Q92556 727 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ATOH8Q96SQ7 321 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 PCED1AQ9H1Q7 454 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 RMI1Q9H9A7 625 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 DMTF1Q9Y222 760 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 FPGTO14772 594 aa30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 RAD51BO15315 384 aa30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 LILRB5O75023 590 aa30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 MPC1LP0DKB6 136 aa30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 BGNP21810 368 aa30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CXCL12P48061 93 aa30.51■■■□□ 2.48
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