RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586312.5

PSME3-208, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 5

Gene PSME3, Length 752 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-208	ENST00000586312	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ALDH4A1	P30038	563 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	MC4R	P32245	332 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CSF2RB	P32927	897 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	FASLG	P48023	281 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CACNG1	Q06432	222 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PTPRCAP	Q14761	206 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TPSAB1	Q15661	275 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	AMZ1	Q400G9	498 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	USP53	Q70EK8	1073 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PCGF5	Q86SE9	256 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	AMZ2	Q86W34	360 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	COG1	Q8WTW3	980 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PEX13	Q92968	403 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	RANBP9	Q96S59	729 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	THSD1	Q9NS62	852 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	KLC4	Q9NSK0	619 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312		A0A0G2JNG1	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CCDC188	H7C350	402 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	GPR39	O43194	453 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	UGT1A9	O60656	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CPNE6	O95741	557 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ITGA2B	P08514	1039 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	UGT1A6	P19224	532 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	UGT1A1	P22309	533 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	UGT1A4	P22310	534 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	UGT1A3	P35503	534 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	GPR3	P46089	330 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CLCNKA	P51800	687 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SQSTM1	Q13501	440 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	KIR2DS5	Q14953	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CYP1B1	Q16678	543 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PCID2	Q5JVF3	399 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ARMC3	Q5W041	872 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CASC4	Q6P4E1	433 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	IYD	Q6PHW0	289 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SLC38A3	Q99624	504 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	STRADB	Q9C0K7	418 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CASS4	Q9NQ75	786 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312		H7C0S8	307 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF185	O15231	689 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	LDB2	O43679	373 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	F3	P13726	295 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	SLC5A2	P31639	672 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	ARSD	P51689	593 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	LIMK2	P53671	638 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	TERF1	P54274	439 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	MAP9	Q49MG5	647 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	CCDC38	Q502W7	563 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-208	ENST00000586312	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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