RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 CXorf40BQ96DE9 158 aa30.19■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 WASH6PQ9NQA3 447 aa30.19■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 FAM8A1Q9UBU6 413 aa30.19■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 WDR37Q9Y2I8 494 aa30.19■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 AGAP14A8MT82 685 aa30.18■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 HGSO14964 777 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 THRAP10827 490 aa30.18■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 RALBP11234 206 aa30.18■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 HALP42357 657 aa30.18■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
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CMTM4-204ENST00000563952 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP30.18■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 SNAP47Q5SQN1 464 aa30.18■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
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CMTM4-204ENST00000563952 TAS2R42Q7RTR8 314 aa30.18■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 STYXQ8WUJ0 223 aa30.18■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 COPS8Q99627 209 aa30.18■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 PSMD13Q9UNM6 376 aa30.18■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
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CMTM4-204ENST00000563952 KLK10O43240 276 aa30.17■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 SUN1O94901 812 aa30.17■■■□□ 2.42
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CMTM4-204ENST00000563952 TLE3Q04726 772 aa30.17■■■□□ 2.42
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CMTM4-204ENST00000563952 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa30.17■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 POT1Q9NUX5 634 aa30.17■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa30.17■■■□□ 2.42
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CMTM4-204ENST00000563952 CFAP99D6REC4 459 aa30.16■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 APRTP07741 180 aa30.16■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 PRSS56P0CW18 603 aa30.16■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 CCL4P13236 92 aa30.16■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 KCNJ1P48048 391 aa30.16■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 GPR33Q49SQ1 333 aa30.16■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 USP7Q93009 1102 aa30.16■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 UCK1Q9HA47 277 aa30.16■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 JRKLQ9Y4A0 524 aa30.16■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 MGAT4DA6NG13 374 aa30.15■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 MROH6A6NGR9 719 aa30.15■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 H7C0S8 307 aa30.15■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
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CMTM4-204ENST00000563952 HEXDCQ8WVB3 486 aa30.15■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 DPH1Q9BZG8 443 aa30.15■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 KCNF1Q9H3M0 494 aa30.15■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 EPB41L1Q9H4G0 881 aa30.15■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 WDR70Q9NW82 654 aa30.15■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa30.15■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 KLHL3Q9UH77 587 aa30.15■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 CHD6Q8TD26 2715 aa30.14■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 PRAMEF10O60809 474 aa30.14■■■□□ 2.42
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CMTM4-204ENST00000563952 ACRV1P26436 265 aa30.14■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 CACNG1Q06432 222 aa30.14■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 SKIDA1Q1XH10 827 aa30.14■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 BROXQ5VW32 411 aa30.14■■■□□ 2.42
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CMTM4-204ENST00000563952 SLC40A1Q9NP59 571 aa30.14■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 HOMER3Q9NSC5 361 aa30.14■■■□□ 2.42
CMTM4-204ENST00000563952 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
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CMTM4-204ENST00000563952 SGTAO43765 313 aa30.13■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 UBXN7O94888 489 aa30.13■■■□□ 2.41
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CMTM4-204ENST00000563952 AMD1P17707 334 aa30.13■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 ARSDP51689 593 aa30.13■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 BASP1P80723 227 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 GPR18Q14330 331 aa30.13■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 RPE65Q16518 533 aa30.13■■■□□ 2.41
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CMTM4-204ENST00000563952 METRNLQ641Q3 311 aa30.13■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 PRELID2Q8N945 189 aa30.13■■■□□ 2.41
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CMTM4-204ENST00000563952 CASS4Q9NQ75 786 aa30.13■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 OGFRQ9NZT2 677 aa30.13■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 PDP2Q9P2J9 529 aa30.13■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 ITPR1Q14643 2758 aa30.13■■■□□ 2.41
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CMTM4-204ENST00000563952 HEATR9A2RTY3 570 aa30.12■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 MSNP26038 577 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 PRLHRP49683 370 aa30.12■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 FAM129CQ86XR2 697 aa30.12■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 WWP1Q9H0M0 922 aa30.12■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 FOXJ2Q9P0K8 574 aa30.12■■■□□ 2.41
CMTM4-204ENST00000563952 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
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