RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562291.2

INO80E-204, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-204ENST00000562291 DDHD1Q8NEL9 900 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 TTC9Q92623 222 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 NKD1Q969G9 470 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 SGF29Q96ES7 293 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 DCUN1D1Q96GG9 259 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 CTRCQ99895 268 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 ZPBPQ9BS86 351 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 DDA1Q9BW61 102 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 FBXO8Q9NRD0 319 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 WDR37Q9Y2I8 494 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 MGAT4DA6NG13 374 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 PRR19A6NJB7 356 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 GPR39O43194 453 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 PRAMEF1O95521 474 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 RALBP11234 206 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 TPH1P17752 444 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 HADHAP40939 763 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 SEPHS1P49903 392 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 XIAPP98170 497 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 FOXM1Q08050 763 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 RPE65Q16518 533 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 FNBP1LQ5T0N5 605 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 METRNLQ641Q3 311 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 DENND5AQ6IQ26 1287 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 ZNF605Q86T29 641 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 OR13C4Q8NGS5 318 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 PMEPA1Q969W9 287 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 C9orf72Q96LT7 481 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 TGM7Q96PF1 710 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 POT1Q9NUX5 634 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 OGFRQ9NZT2 677 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 CRLS1Q9UJA2 301 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 BPTFQ12830 3046 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 KRT86O43790 486 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 RAD1O60671 282 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 RASSF9O75901 435 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 METTL18O95568 372 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 C9P02748 559 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 POLBP06746 335 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 STIP1P31948 543 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 ARSDP51689 593 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 GFERP55789 205 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 DMPKQ09013 629 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 GPR18Q14330 331 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 NFE2L1Q14494 772 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 KRT33BQ14525 404 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 IRGCQ6NXR0 463 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 XKR5Q6UX68 686 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 TAS2R42Q7RTR8 314 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 SNX20Q7Z614 316 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 ZNF843Q8N446 348 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 BMPERQ8N8U9 685 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 EXTL1Q92935 676 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 ULK4Q96C45 1275 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 RTP4Q96DX8 246 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 HES6Q96HZ4 224 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 APMAPQ9HDC9 416 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 SMOXQ9NWM0 555 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 PILRAQ9UKJ1 303 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 ACSL5Q9ULC5 683 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.47□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 KLHL33A6NCF5 533 aa9.47□□□□□ -0.89
INO80E-204ENST00000562291 CFAP99D6REC4 459 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms