RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557331.1

RDH11-210, Transcript of retinol dehydrogenase 11, humanhuman

TSL 4

Gene RDH11, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH11-210ENST00000557331 BRAFP15056 766 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 FOLR1P15328 257 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 IL4RP24394 825 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 RPL10P27635 214 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 LAMB3Q13751 1172 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 PLCL1Q15111 1095 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 FILIP1LQ4L180 1135 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 SLC6A19Q695T7 634 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 CRTC3Q6UUV7 619 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 IGFL3Q6UXB1 125 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 OOSP2Q86WS3 158 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 KCTD6Q8NC69 237 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 HDAC11Q96DB2 347 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 SGSM3Q96HU1 749 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 AGAP3Q96P47 875 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 GPR63Q9BZJ6 419 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 TRIM7Q9C029 511 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 HAUS4Q9H6D7 363 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 HRASLS2Q9NWW9 162 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 MAP10Q9P2G4 905 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 SLC23A2Q9UGH3 650 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 TCFL5Q9UL49 500 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 ACSL5Q9ULC5 683 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 BTRCQ9Y297 605 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa10□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 OR5K3A6NET4 321 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 C9J4A7 227 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 MEN1O00255 615 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 AGXTP21549 392 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 NDUFS1P28331 727 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 TNFRSF8P28908 595 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 HMGCLP35914 325 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 CD86P42081 329 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 PTGIRP43119 386 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 ITGA1P56199 1179 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 RIPPLY3P57055 190 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 KLHL30Q0D2K2 578 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 PRKAA1Q13131 559 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 SASS6Q6UVJ0 657 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 NT5DC3Q86UY8 548 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 ZNF547Q8IVP9 402 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 DSELQ8IZU8 1212 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 CCNYQ8ND76 341 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 GPR26Q8NDV2 337 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 FDCSPQ8NFU4 85 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 NACC2Q96BF6 587 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 APCP25054 2843 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 HEATR9A2RTY3 570 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 LRRC53A6NM62 1247 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 ZNF487B1APH4 448 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 MFSD11O43934 449 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 TIAF1O95411 115 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 HLA-DQB2P05538 268 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 EBLN1P0CF75 366 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 CDK18Q07002 472 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 IL10RAQ13651 578 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 ITGA9Q13797 1035 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 DPYSL3Q14195 570 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 RPE65Q16518 533 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 METRNLQ641Q3 311 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 CPZQ66K79 652 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 ZNF787Q6DD87 383 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 VSIG1Q86XK7 387 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 Q8NA96 180 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 CLEC1AQ8NC01 280 aa9.98□□□□□ -0.81
RDH11-210ENST00000557331 GDAP1Q8TB36 358 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms