RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 G3V2T6 193 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 K7EPI3 171 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CLDN11O75508 207 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 KRT33AO76009 404 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SOX30O94993 753 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FTCDO95954 541 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CD2P06729 351 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 UMPSP11172 480 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 OR1E1P30953 314 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ADH7P40394 386 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GSTM5P46439 218 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 STT3AP46977 705 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 KCNJ10P78508 379 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MLC1Q15049 377 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TPRA1Q86W33 373 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PPM1NQ8N819 430 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ASB15Q8WXK1 588 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NXPE3Q969Y0 559 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FEM1CQ96JP0 617 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0B4J269 797 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FAM86B1E9PN63 330 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TM9SF1O15321 606 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEB3O15480 346 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 KDM4BO94953 1096 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NDST1P52848 882 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ADAM15Q13444 863 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TUBB3Q13509 450 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PWP1Q13610 501 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DLG2Q15700 870 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ESCO2Q56NI9 601 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM159Q96B96 161 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC126Q96EE4 140 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FAR2Q96K12 515 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NEMP2A6NFY4 417 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CFLARO15519 480 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJB6O75190 326 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SUPT7LO94864 414 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 OXTRP30559 389 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 IRS1P35568 1242 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SP2Q02086 613 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GBE1Q04446 702 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MPP2Q14168 576 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SGO1Q5FBB7 561 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TRIQKQ629K1 86 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SHC4Q6S5L8 630 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FZD1Q9UP38 647 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 F8W036 122 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PIK3R2O00459 728 aa6.24□□□□□ -1.41
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