RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	MACC1	Q6ZN28	852 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SIX5	Q8N196	739 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXO27	Q8NI29	283 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PTER	Q96BW5	349 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	MYO19	Q96H55	970 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CATSPER2	Q96P56	530 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	P2RY12	Q9H244	342 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	LHX3	Q9UBR4	397 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	POLG2	Q9UHN1	485 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	VPS51	Q9UID3	782 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	GREM1	O60565	184 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	KATNA1	O75449	491 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	FGF18	O76093	207 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CD160	O95971	181 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	OTC	P00480	354 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	C8B	P07358	591 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PRR35	P0CG20	571 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	UMPS	P11172	480 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	FCGR1A	P12314	374 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	HSD17B1	P14061	328 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	UQCRB	P14927	111 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CHRM3	P20309	590 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	FMO4	P31512	558 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	NSG1	P42857	185 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CCR3	P51677	355 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SH3BP2	P78314	561 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CDKL1	Q00532	357 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ADRM1	Q16186	407 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	AGK	Q53H12	422 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	LILRA6	Q6PI73	481 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	HPS6	Q86YV9	775 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PDPR	Q8NCN5	879 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	GATA6	Q92908	595 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	RCN3	Q96D15	328 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SGF29	Q96ES7	293 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR21	Q99679	349 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	IL21	Q9HBE4	155 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	KCTD3	Q9Y597	815 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ACOT8	O14734	319 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ANGPT2	O15123	496 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC16A5	O15375	505 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SUPT3H	O75486	399 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	GLUD1	P00367	558 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF30	P17039	623 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	VCL	P18206	1134 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	EPHA5	P54756	1037 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SESN3	P58005	492 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ERVK-8	P63133	956 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TRAF2	Q12933	501 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TDG	Q13569	410 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PEX6	Q13608	980 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	OR4D1	Q15615	310 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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