RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 DNASE1L2Q92874 299 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NTAN1Q96AB6 310 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ART5Q96L15 291 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM2Q9C040 744 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1W2PQ72 361 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 BPGMP07738 259 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PRKAR1AP10644 381 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SLC7A2P52569 658 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CRHR2Q13324 411 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CUZD1Q86UP6 607 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ATCAYQ86WG3 371 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ROPN1LQ96C74 230 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FZD9O00144 591 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 WNT9AO14904 365 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SLC7A4O43246 635 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FSBPO95073 299 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINA1P01009 418 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF30P17039 623 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FUT2Q10981 343 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GKN2Q86XP6 184 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 HM13Q8TCT9 377 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ING3Q9NXR8 418 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SRRDQ9UH36 339 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PHF11Q9UIL8 331 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DUXAA6NLW8 204 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PIGRP01833 764 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RPS6KA3P51812 740 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FAM189A2Q15884 450 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DEF8Q6ZN54 512 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 OR4C6Q8NH72 309 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MPP4Q96JB8 637 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MIPEPQ99797 713 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CNTN3Q9P232 1028 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ILVBLA1L0T0 632 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 STX16O14662 325 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MFSD11O43934 449 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PIRTP0C851 137 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NR2C1P13056 603 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MTHFRP42898 656 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SPIN4Q56A73 249 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TEX46H3BTG2 121 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 OR1F1O43749 312 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
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