RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 SURF4O15260 269 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MID1O15344 667 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TRAPPC3O43617 180 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 AIREO43918 545 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 RHCEP18577 417 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PRKACBP22694 351 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CCND2P30279 289 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SPRP35270 261 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MARCKSL1P49006 195 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 UGT2B15P54855 530 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ARHGAP1Q07960 439 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PRKAA1Q13131 559 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CTBP1Q13363 440 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NAE1Q13564 534 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM132DQ14C87 1099 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 UPP1Q16831 310 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 STXBP5Q5T5C0 1151 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 HES5Q5TA89 166 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 GPR65Q8IYL9 337 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM199Q8N511 208 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF614Q8N883 585 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NFKBIDQ8NI38 313 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 FBXO30Q8TB52 745 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 RSC1A1Q92681 617 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MAL2Q969L2 176 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ECHDC3Q96DC8 303 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM209Q96SK2 561 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 KATNBL1Q9H079 304 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PPA2Q9H2U2 334 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM216Q9P0N5 145 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 HCN2Q9UL51 889 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TMED5Q9Y3A6 229 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NOX1Q9Y5S8 564 aa3.13□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PRORSD1PA6NEY8 169 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 F5H423 210 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 GCATO75600 419 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 FADS2O95864 444 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM253P0C7T8 217 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TXNP10599 105 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 LIPCP11150 499 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 RNH1P13489 461 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CRISP2P16562 243 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ACO1P21399 889 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 GLDCP23378 1020 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PSMA2P25787 234 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CNTFP26441 200 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SERPINA4P29622 427 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 HPCAL1P37235 193 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC1A4P43007 532 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 OR1G1P47890 313 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MAP2K6P52564 334 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ADAM8P78325 824 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 GAS6Q14393 721 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF460Q14592 562 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 LCLAT1Q6UWP7 414 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 XKR5Q6UX68 686 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CLEC4GQ6UXB4 293 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 USP49Q70CQ1 688 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 C6orf120Q7Z4R8 191 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TMPRSS6Q8IU80 811 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 C4orf19Q8IY42 314 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 OR14L1PQ8NHC6 308 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 KCNV2Q8TDN2 545 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ASB12Q8WXK4 309 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 HTRA1Q92743 480 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PANX3Q96QZ0 392 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 IL4I1Q96RQ9 567 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PHOX2BQ99453 314 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 FLRT1Q9NZU1 646 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 UBQLN2Q9UHD9 624 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 KCNH4Q9UQ05 1017 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PKP3Q9Y446 797 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ABCC4O15439 1325 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MSH6P52701 1360 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ARGFXA6NJG6 315 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 LGR5O75473 907 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 RAB3DO95716 219 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms