RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529524.1

PSMA1-208, Transcript of proteasome subunit alpha 1, human

TSL 3

Gene PSMA1, Length 743 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA1-208	ENST00000529524	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	TMEM94	Q12767	1356 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ABCC3	O15438	1527 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ATP7A	Q04656	1500 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	IQGAP1	P46940	1657 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	AFF2	P51816	1311 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	PZP	P20742	1482 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ABCA6	Q8N139	1617 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	DUXA	A6NLW8	204 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524		J3KRW8	73 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC25A12	O75746	678 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	CD48	P09326	243 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	TSPY4	P0CV99	314 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	TSPY10	P0CW01	314 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ERVK-10	P10266	1014 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF23	P17027	643 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	TAF1	P21675	1872 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	NFKBIA	P25963	317 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	AHR	P35869	848 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	KRT2	P35908	639 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	LPAL2	Q16609	132 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ALG11	Q2TAA5	492 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	MYLK3	Q32MK0	819 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ZFP69	Q49AA0	526 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF280D	Q6N043	979 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	PDILT	Q8N807	584 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	FRMD1	Q8N878	549 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	THAP6	Q8TBB0	222 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	UCMA	Q8WVF2	138 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	C7orf26	Q96N11	449 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	MAP7D2	Q96T17	732 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	IFNL4	K9M1U5	179 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	NDUFS3	O75489	264 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	TMEM63A	O94886	807 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	MBD4	O95243	580 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	GNB3	P16520	340 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	CHM	P24386	653 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	NR2F2	P24468	414 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	HOXC9	P31274	260 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	MAP2K2	P36507	400 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	PIK3CA	P42336	1068 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	FASLG	P48023	281 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	F2RL1	P55085	397 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	MLLT10	P55197	1068 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ZBED6	P86452	979 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	TFAP4	Q01664	338 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	LRMP	Q12912	555 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	TMEM187	Q14656	261 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	NAB2	Q15742	525 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	C18orf63	Q68DL7	685 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	TRIM58	Q8NG06	486 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	SGCD	Q92629	289 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	APBB2	Q92870	758 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF653	Q96CK0	615 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	ACOX2	Q99424	681 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PSMA1-208	ENST00000529524	STRA6	Q9BX79	667 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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