RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520548.1

RNF145-208, Transcript of ring finger protein 145, human

TSL 4

Gene RNF145, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF145-208	ENST00000520548	TCF12	Q99081	682 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	ERP44	Q9BS26	406 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	OR2AG1	Q9H205	316 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	WHRN	Q9P202	907 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	SOX13	Q9UN79	622 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	CHUK	O15111	745 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	YY2	O15391	372 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	TTI1	O43156	1089 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	NDUFS3	O75489	264 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	C1QL1	O75973	258 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	USP1	O94782	785 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	SOD1	P00441	154 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	CKMT1A	P12532	417 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	PNLIP	P16233	465 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	PGAM1	P18669	254 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	ACP1	P24666	158 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	PSMA3	P25788	255 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	ACRV1	P26436	265 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	MGAT1	P26572	445 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	NDUFS1	P28331	727 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	ACVR1	Q04771	509 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	C1orf61	Q13536	156 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	PTPRR	Q15256	657 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	BCL7A	Q4VC05	210 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	SYTL3	Q4VX76	610 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	CCDC157	Q569K6	752 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	KLHL35	Q6PF15	583 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	PACS1	Q6VY07	963 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	HM13	Q8TCT9	377 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	MAPK15	Q8TD08	544 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	HDAC10	Q969S8	669 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	SMIM14	Q96QK8	99 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	AGAP2	Q99490	1192 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	KIFC1	Q9BW19	673 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	LGR4	Q9BXB1	951 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	CLPB	Q9H078	707 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	ZMYND15	Q9H091	742 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	GULP1	Q9UBP9	304 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	PADI4	Q9UM07	663 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	NUMA1	Q14980	2115 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548		A0A0U1RQS6	177 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	MGAT4D	A6NG13	374 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	AGAP14	A8MT82	685 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548		B4DGG1	531 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	SIGLEC6	O43699	453 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	DNAJC6	O75061	913 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	SPAG6	O75602	509 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	RPN2	P04844	631 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	GSTA2	P09210	222 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RNF145-208	ENST00000520548	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		7.73	□□□□□ -1.17

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