RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	VDR	P11473	427 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	CDK4	P11802	303 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	PRKCH	P24723	683 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	HLA-F	P30511	346 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	GRK6	P43250	576 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	SEC24C	P53992	1094 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	INHBC	P55103	352 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	ADIG	Q0VDE8	80 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	MPP3	Q13368	585 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM215	Q68D42	235 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552		Q6ZNX1	250 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	BEND5	Q7L4P6	421 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	DEFB119	Q8N690	84 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	SPATA20	Q8TB22	786 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF139	Q8WU17	664 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	SEMA4D	Q92854	862 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	CAVIN3	Q969G5	261 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	IGSF8	Q969P0	613 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	GSDMA	Q96QA5	445 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	TSG101	Q99816	390 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	TOR3A	Q9H497	397 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	GAREM1	Q9H706	876 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	SGK2	Q9HBY8	427 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	GGA2	Q9UJY4	613 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	C10orf142	B7Z368	130 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552		E7ENQ6	273 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	TAF4	O00268	1085 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	P4HA2	O15460	535 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	YKT6	O15498	198 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	PEX1	O43933	1283 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	TSPAN3	O60637	253 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	SEMA4F	O95754	770 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	DNTT	P04053	509 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	HMBS	P08397	361 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	PPP3CB	P16298	524 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	CD27	P26842	260 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	PPP1R2	P41236	205 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	CCT8	P50990	548 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	NXPH1	P58417	271 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	DAOA	P59103	153 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	BNC1	Q01954	994 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	HLA-B	Q31612	363 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	CBWD6	Q4V339	395 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	MPP5	Q8N3R9	675 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC9A6	Q92581	669 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC35C1	Q96A29	364 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM136A	Q96C01	138 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	HSFY1	Q96LI6	401 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	SERPINB11	Q96P15	392 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	SUN2	Q9UH99	717 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PDE4D-222	ENST00000514552	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms