RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514183.5

RACK1-231, Transcript of receptor for activated C kinase 1, human

TSL 2

Gene RACK1, Length 1,439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RACK1-231	ENST00000514183	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SLC12A1	Q13621	1099 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	GALNT3	Q14435	633 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TLR1	Q15399	786 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SLC14A2	Q15849	920 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	COX20	Q5RI15	118 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	NEK5	Q6P3R8	708 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CACUL1	Q86Y37	369 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	APCDD1	Q8J025	514 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CNPY4	Q8N129	248 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	OR4C6	Q8NH72	309 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TTC9	Q92623	222 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ALG14	Q96F25	216 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SLC6A18	Q96N87	628 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TRIB3	Q96RU7	358 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	RBBP8	Q99708	897 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TREX1	Q9NSU2	369 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	LHX3	Q9UBR4	397 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ATM	Q13315	3056 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183		A0A1W2PR77	199 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	WDR91	A4D1P6	747 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	MROH6	A6NGR9	719 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183		K7ERQ8	282 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	MEN1	O00255	615 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	LAT	O43561	262 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	NDST3	O95803	873 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CD160	O95971	181 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	EPO	P01588	193 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CR2	P20023	1033 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TAC1	P20366	129 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SLC8A1	P32418	973 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CD70	P32970	193 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CRHR1	P34998	444 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SERPINB8	P50452	374 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	RHOA	P61586	193 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	PDE1B	Q01064	536 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CNGA3	Q16281	694 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	PDK4	Q16654	411 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM215	Q68D42	235 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	PCSK4	Q6UW60	755 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ATCAY	Q86WG3	371 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	GGT7	Q9UJ14	662 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CHKB	Q9Y259	395 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183		A0A1W2PP55	124 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183		H3BM21	787 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	EBAG9	O00559	213 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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